第三章 蛋白质相互作用.ppt

第三章 蛋白质相互作用 蛋白质相互作用（protein-protein interaction，PPI）是指两个或两个以上的蛋白质分子通过非共价键形成蛋白质复合体（ protein complex）的过程 分子机器 蛋白质复合体是生命分子机器的核心结构 蛋白质复合体的形式 二聚体dimer 三聚体trimer 寡聚体oligomer 多聚体polymer 同聚体homopolymer 异聚体heteropolymer 复合体的形状 复合体的稳定性 细胞内环境有利用蛋白质复合体的形成 体外PPI研究难以模拟细胞内环境 蛋白质网络（interactome） PPI的结构基础 PPI 界面依靠非共价键维系 氢键 范德华力 疏水力 离子键 共价键 PPI 界面大小影响稳定性 蛋白质相互作用结构域 结构域是蛋白质中折叠较为紧密且具有一定功能的球状和纤维状的结构，以模块方式具有多种不同功能的分子。 蛋白质相互作用结构域专指那些可以识别其他蛋白质的特殊结构，从而介导两个蛋白之间发生相互作用的结构域，一般由50-100个氨基酸组成。 结构域结构域相互作用 结构域-肽段模体相互作用 SH2结构域 约100个氨基酸序列，识别磷酸化的酪氨酸及相邻的3-6个氨基酸残基。 SH3结构域 由50个氨基酸残基组成，存在于各种蛋白激酶和衔接蛋白