化学合成siRNAsiRNA设计方法.doc

siRNA化学合成 化学合成siRNA简介 化学合成siRNA是应用起来最方便的方法，客户只需提供siRNA序列或者GeneID、Accession Number、基因名称等。 百奥迈科(Biomics)公司的siRNA使用国外最先进的仪器合成，同时配备了高容量的HPLC纯化仪。单个靶点siRNA合成量一次性可放大到克(g)级，年产更达到公斤(Kg)级。产品经过严格质检，确保质量并提供质量检查报告。 化学合成的siRNA与生物合成siRNA相比，有以下优点： 操作简便，研究人员得到合成好的siRNA后，进行简单的稀释处理即可实验。 转染效率高，相对于分子量较大的DNA质粒，其转染效率高。 对细胞的或者组织的毒副作用小。 可大规模制备，本公司的合成规模可达到克级 (一次合成量1 - 100 g) 特别适用于基因靶位点已确定，需要大量siRNA进行siRNA动物实验研究。 欢迎您使用Biomics的siRNA产品，我们始终为您提供优质热诚的服务！ siRNA设计 siRNA序列的结构对RNAi实验的成功与否起着至关重要的作用。不同的siRNA序列，对基因的沉默效率差异很大。因此，理性设计有效的siRNA就成为实验成功的关键因素之一。 本公司推荐考虑如下设计思想： 从起始密码子下游50 - 100个nt开始，避免5端或3端的UTRs，搜索AA (N19) 序列。因为这些区域结合了大量的调控蛋白，可能会影响siRNA发挥作用。 分析siRNA两端能量分布 N19序列3端垂悬两个dTdT，该垂悬不与mRNA序列互补，使有义链3’端更容易解链，从而增加其沉默效率。 21个碱基的siRNA单链序列如：5-GGCCAGAGGUUGAAAGUGAdTdT-3 对mRNA目标区域进行二级结构预测，排除作用复杂的二级结构的siRNA序列。因为二级结构越复杂，siRNA沉默效率越低。 下图表明设计的siRNA结构优势依次递增a) b) c) 在NCBI数据库（/Blast.cgi）中进行Blast对照，排除设计的序列和其他基因的同源性，降低脱靶效应。 避免出现连续的多个G或C，GC含量最好在30 – 55 %之间。 设计中，对siRNA两端的错配可以高度容忍，但中间的5 - 11位碱基的错配，对沉默效应会有较大影响。 本公司专业技术人员免费帮您针对同一个基因设计3 - 4对siRNA，您只需提供基因的Accession Number、mRNA序列或者Gene ID等信息即可，设计好后交您确认，如果抑制效率达不到70 % (转染效率至少90 %)，我们免费重新设计和合成。 百奥迈科(Biomics) siRNA产品简介 ● siRNA合成： 本公司拥有siRNA合成所有核心技术和专业合成团队，合成规模达到克级 (一次合成量1 - 100 g) ● 标记 可对siRNA两条链的4个末端进行多种标记物的标记，包括FAM、Cy3、Cy5、胆固醇(cholesterol)、Biotin等，以便根据实验要求监测siRNA抑制特异性基因表达的效果。 ● 修饰： 提供siRNA的化学修饰，主要有2’-羟基甲基化修饰，磷酸硫代修饰，氟代修饰等。 ● 纯化： HPLC纯化。 ● 长度： 19-23nt，亦可根据设计要求合成相应长度的siRNA。 ● 产品形式： 冻干粉 ● 储存和稳定性： 建议在- 20 °C的环境中贮存，避免反复冻融，可保存6个月。荧光标记的RNA必须避光保存。 ● 技术数据表： 技术数据表与siRNA oligo一同交付，包括名称、序列、浓度、OD和nmols的精确数量及纯化类型。 ● 个性服务： 按照客户要求分装。 免费设计。 ● 运输： 1.5mL冻存管，快递寄送。 普通siRNA oligo Biomics公司普通的siRNA oligo根据客户要求，采用脱盐、PAGE或HPLC纯化的方法，有效去除短、杂片段。客户只需用无RNA酶水稀释后即可使用。 我们为客户设计合成四个靶点的普通siRNA，提高筛选出潜在的特异性抑制效率高的序列的机会。 目录号 产品说明 规格 纯化方式 价格 CS1004 普通 siRNA 4 OD HPLC CS1005 普通 siRNA 5 OD HPLC CS1010 普通 siRNA 10 OD HPLC CS1050 普通 siRNA 50 OD HPLC CS1100 普通 siRNA 100 OD HPLC CS1250 普通 siRNA 250 OD HPLC 荧光标记siRNA oligo 本公司可对siRNA两条链的4个末端进行多种标记物的标记，包括FAM、Cy3、Cy5、胆固醇(cholesterol)、Biotin。相对于未标记的siRNA具有转染