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鮈亚科鱼类的分子系统发育关系分析.pdf

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摘要 摘要 种,主要分布在东亚。关于绚亚科鱼类的系统发育位置,形态与分子证据的研究 间没有取得一致的结论,但是分子证据的研究均强烈支持绚亚科、鲡亚科 科鱼类形成单系群,但是这些亚科问鱼类的关系没有解析清楚。关于绚亚科鱼类 属间系统发育关系,基于形态学证据的研究主要是对觞亚科鱼类进行了大类群的 划分,然而没有取得一致的结论。基于分子证据的研究强烈地支持‘鲭属 Sarcocheilichthyini鱼类的单系性则缺乏统计支持度。 因此,本论文聚焦于解析觞亚科鱼类的系统发育关系亟需解决的两个问题: 1)约亚科在鲤科鱼类中的系统发育位置。2)绚亚科鱼类内部各属之问的系统发 育关系。本研究基于线粒体基因组全序列与核基因多位点的分子证据,重建了拘 亚科鱼类的分子系统发育关系。 主要研究结果如下: 1、约亚科鱼类的系统发育位置 基于12个核基因的多位点证据,重建了绚亚科、鲡亚科、丁鳞亚科、雅罗 鱼亚科、Oxygastrinae亚科鱼类之间的系统发育关系。结果表明:基于核基因联 合数据集的最大似然法分析和贝叶斯分析,得到了相同的拓扑结构(图2一1)。结 2)绚亚科与鲡亚科鱼类形成姊妹群关系,它 果表明:1)支持绚亚科为单源群i 们一起是丁鲮亚科丁鳞属1inca鱼类的姊妹群;3)雅罗鱼亚科与丁鳞亚科唐鱼 属Tanichthys鱼类形成姊妹群关系,它们一起是拘亚科+鳎亚科+丁鳞亚科丁 鳞属鱼类的姊妹群;4)绚亚科、鲡亚科、丁鳞亚科与雅罗鱼亚科鱼类一起是 Oxygastrinae亚科鱼类的姊妹群。 2.基于线粒体基因组全序列的绚亚科鱼类属间系统发育关系 基于线粒体基因组全序列证据,本研究重建了绚亚科鱼类属间系统发育关系。 结果表明:1)觞亚科鱼类可分成3个谱系:‘垒骨属+银绚属’谱系位于基部, 鲸族与绚族鱼类形成姊妹群关系;2)‘鳙属+银绚属谱系’包括鳙属与银觞属; 万方数据 摘要 位于基部,平口绚属Ladislavia鱼类位于次基部,觞属鱼类与所有保留的鲴族鱼 棒花鱼属Abbottina与蛇觞属Saurogobio的姊妹群。 3.基于核基因多位点证据的的亚科鱼类属间系统发育关系 基于15个核基因的多位点证据,本研究获得了解析清楚的纳亚科鱼类属间 系统发育关系。结果表明:1)觞亚科鱼类可分成4个谱系:‘鲭属:+银绚属! 谱系位于基部,鲸族与绚族鱼类形成姊妹群关系,它们一起是‘铜鱼属+吻绚 属’谱系的姊妹群。2)鲳属一银觞属谱系内部,似鲭属嵌套在鲳属内部,它们一 起是银绚属鱼类的姊妹群;3)‘铜鱼属+吻绚属’谱系包括铜鱼属和吻筋属;4) 在鲸族鱼类内部,颌须觞属是绚鲫属鱼类的姊妹群,它们一起位于基部,‘扁吻 觞属+拟扁吻绚属+麦穗鱼属’以及‘鲸属+高丽雅罗鱼属十似刺鳊觞属’ 鱼类各自形成单系群,它们相互之间形成姊妹群关系;5)在绚族鱼类内部,平 口绚属鱼类位于基部;觞属与罗马诺绚属鱼类形成姊妹群关系,它们一起位于次 基部;鳅鸵属与异鳔鳅鸵属鱼类形成姊妹群关系,它们一起与所有保留的筋族鱼 类形成姊妹群关系;‘小鳔鲷属+突吻觞属+琵琶绚属+片唇绚属’鱼类一 起形成单系群,它们一起是胡绚属鱼类的姊妹群;‘小鳔觞属+突吻鲷属+琵 琶觞属+片唇胸属+胡绚属’鱼类一起是棒花鱼属鱼类的姊妹群,它们一起 与蛇绚属鱼类形成姊妹群关系;小鳔绚属、突吻拘属、琵琶绚属、片唇绚属、胡 觞属、棒花鱼与蛇绚属鱼类一起是似绚属鱼类的姊妹群。 综上所述,本论文基于线粒体基因组全序列和核基因多位点分子证据:1) 确认了绚亚科鱼类是单源群,姊妹群为蛹亚科;2)较好地解析了鱼句亚科鱼类属 问系统发育关系。本研究为进一步开展啻坷亚科鱼类系统学与生物地理学研究奠定 了基础,并将推进鲤科鱼类系统学研究的进展。 关键词: 绚亚科、鲤科、线粒体基因组全序列、核基因、系统发育 中图分类号:Q1

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