采用基因芯片筛新新选肝癌转移相关基因的研究探究.pdfVIP

中国临床肿瘤学教育专辑 (2007) 405 采用基因芯片筛选肝癌转移相关基因的研究 第二军医大学东方肝胆外科医院综合治疗一科 葵 沈 锋 施乐华 阎振林 卫立信 丛文铭 孟超 摘要 目的：用人基因表达谱 cDNA 芯片研究原发性肝癌(HCC)与癌旁正常肝组织的基因 表达差异并进行验证。方法：利用含有人5075 个基因cDNA 的人表达谱芯片，将6 例原发性肝 癌患者分为伴和不伴门静脉癌栓两组(A 组和B 组，每组n=3)，分别取癌组织、癌栓组织和癌旁 正常肝组织，分别抽提总mRNA,反转录为cDNA 与芯片进行杂交，对比mRNA 表达的差异。 在差异表达的基因中，选取9 个基因在41 例肝癌病人癌和癌旁正常肝组织进行RT-PCR 实验验 证其表达情况。 结果：癌组织及癌栓组织与癌旁正常肝组织比较，伴门脉癌栓组(A 组)癌组织 与不伴门脉癌栓组(B 组)癌组织中上调表达基因分别有169 和170 个，两组下调表达基因分别有 349 和364 个，其中两组共同上调表达基因中135 个，共同下调表达基因305 个。两组癌组织分 别表达上调和下调的基因之中，表达明显上调的基因(ratio3)无癌栓组有3 个、癌栓组有5 个， 而明显下调的(ratio0.4)无癌栓组有 4 个、癌栓组有 10 个。分别挑选两组癌组织共同高表达基 因(ASPH) 、共同低表达基因(MT1X) 、有癌栓组高表达基因(FACL4 、POSTN 、MAP4K4 、HSF1、 UCHL1 、DAP3 、IARS)共9 个，在41 例HCC 病人组织和四种肝癌细胞系中进行RT-PCR 检测， 其中ASPH、MT- 1X、MAP4K4 、FACL4 、DAP3 、HSF1 在癌组织中的表达与癌旁组织比较有 显著差异或有差异(P ＜0.01 或P ＜0.05) 。结论：基因表达谱cDNA 芯片是检测肝癌差异基因表 达的有效方法，其基因变化可以进一步在RT-PCR 中证实。ASPH、MAP4K4 、FACL4 、DAP3 、 HSF1 和MT- 1X 在癌组织中表达明显高于和低于癌旁组织，在肝癌细胞系中表达亦增高和降低， 但在41 例标本中表达变化与伴或不伴门静脉癌栓相关性不明显。 关键词 cDNA 芯片；肝细 肝癌；门静脉癌栓；基因表达谱 Gene Expression Profile Analysis in Human Hepatocellular Carcinoma predict the risk for metastasis using cDNA Microarrays . 1 1 1 WAN G Kui , SHEN Feng , SHI Le-Hua , WU Meng-Chao Depa rtment of Comp rehensive treatment I,Eastern Hepa tobiliary Surgery Hosp ital,Shanghai200438) Abstract Obj ective: To study the difference in gene expression between hepatocellular carcinoma (HCC) with and without portal vein tumor thromosis(PVTT). Methods: Polymerase chain reaction (PCR) products of 5075 human genes were spotted on a chip in array. cDNAs were then fixed on a glas