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液相色谱! 串联质谱分析组织中基因组
脱氧核糖核酸羟甲基胞嘧啶水平
陈丽宇,) 张立坚,) 张良滔,) 蔡) 春!
(广东医学院,广东 湛江 $!(!% )
摘要:$1 羟甲基胞嘧啶通过阻止脱氧核糖核酸()%; )甲基化转移酶 #()% # )甲基化胞嘧啶来影响 )%; 甲基化
的程度。本文建立了液相色谱1 串联质谱(=1 -, - )测定组织中全基因组$1 羟甲基胞嘧啶水平的方法。采用苯
酚1 氯仿提取组织 )%; ,提取的)%; 用++? 甲酸在 #( @ 下裂解,)%; 裂解液加入同位素胞嘧啶作内标,经%! 吹
干后,加乙腈1 水(, - # ,A, A )溶解,用 =1 -, - 检测$1 羟甲基胞嘧啶的含量,并计算全基因组中$1 羟甲基胞嘧啶
的水平。结果表明,$1 羟甲基胞嘧啶的线性范围为. # % 78, 2= ,相关系数为. ,,/ , ,检出限(信噪比为% 计)和
定量限(信噪比为 # 计)分别为 . $’ 78, 2= 和 . , 78, 2= ;日内相对标准偏差和日间相对标准偏差分别为
$. #%? 和/. !(? ;加标回收率为,. !(? ,’. $%? 。用该方法检测了大鼠大脑组织 )%; 羟甲基化水平,平均结果
为. //? 。该方法简便,重现性好,灵敏度较高,能满足全基因组$1 羟甲基胞嘧啶定量检测的要求。
关键词:液相色谱1 串联质谱;$1 羟甲基胞嘧啶;脱氧核糖核酸羟甲基化;组织
中图分类号:
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