R语言作图之PCA作图和散点图.docVIP

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2019-06-30 发布于四川
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PCA分析和散点图今天主要跟大家演示一下简单的PCA分析，并且以散点图的形式将结果展示出来。首先在进行PCA分析之前，先跟大家稍微讨论下什么是PCA分析。PCA分析又叫主成分分析，其实从字面上来理解我们可以发现它其实是和样品分组相关的。举个简单的例子，我们观察了某种植物的株高、叶片大小、果实大小等等多种性状，并记录每种性状对应的数值。这时候我们想看看根据这些性状信息看看我们观察的样本是否明显的分组现象。每一种性状相当于一个维度。利用PCA分析可以将结果投影到一个低维的向量空间（具体计算就不详述了）。类似的比如我们多个样本的表达谱数据，每个基因在各个样品的