miRNA-靶基因预测算法研究概况.docVIP

miRNA 靶基因预测算法研究概况 摘　要：microRNA(miRNA)是一类约22 个核苷酸(nt)长的非编码小分子RNA，广泛存在于动植物细胞中，通过和靶基因的不精确互补配对而裂解mRNA 或抑制翻译的起始。准确地预测miRNA 靶基因和正确地认识miRNA 及其靶基因的作用机理已成为当前研究的热点。作者试图对目前常用的10 余个高等生物miRNA 靶基因预测软件的实现原理、适用对象及各算法的创新之处等加以综述，以便为进行靶基因 关键词：miRNAs ；靶基因预测；生物信息学；RNA 干扰 miRNA是一类约22nt长的非编码小分子RNA，由长约70nt 可形成发夹结构的前体经dicer 酶剪切而来。通过和信使RNA(mRNA)3 端非翻译区(UTR)不精确互补配对而裂解mRNA 或抑制翻译起始，对细胞分化、增殖、凋亡、致癌、抑癌、胰岛素等内分泌激素的分泌和胆固醇代谢等诸多生物过程进行调节[1-5]。认识miRNA 的作用机制，关键是认识miRNA及其靶基因的相互作用。第一个miRNA及其靶基因于1993年通过经典遗传学方法鉴定，然而直到2001年才相继有其他miRNA 的报道[6-10]。尽管缺乏敏感的miRNA克隆方法和鉴定miRNA靶基因的高通量实验方法，但人们在研究过程中发现，miRNA 和靶基因的相互作用具有一定的规律性，可以允许编程来对其预测[11]，因此，在随