blast简介及其应用.pptVIP

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  • 2019-08-30 发布于广东
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* 分析过程(三) 6.限制条件,我们限制在病毒里面找。 7.其他选项保持默认值 打分矩阵 * 分析过程(四) 8.输出格式选项保持默认值 9.点击开始搜索 * 分析过程(五) 10.查询序列的一些相关信息 在cdd库里面找到两个保守区域,点击可以进入 * 分析过程(六) 图形结果 * 分析过程(七) 匹配序列列表 * 分析过程(八) 具体匹配情况 * 为什么使用单机版的Blast? 1.特殊的数据库要求。 2.涉及序列的隐私与价值。 3.批量处理 4.其他原因?? 单机版的Blast使用(一) * 单机版Blast的基本操作过程 1.下载单机版的Blast程序 /blast/executables/ 目录下,下载对应的操作系统版本。 2.解压程序包(blast-2.28-ia32-linux.tar.gz) 命令是: $ tar zxvf blast-2.28-ia32-linux.tar.gz 单机版的Blast使用(二) * 下载正确的Blast程序包 blast:在本地运行的blast程序包 wwwblast:在本地服务器建立blast服务的网站 netblast:blast的客户端程序,直接链接至NCBI的BLAST服务器,使用BLAST服务,不需浏览器。 * 下载正确的Blast程序包 Blast程序包的名字上还包括了该程序包运行的硬件和操

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