微生物群落基因指纹分析.ppt

微生物群落基因指纹分析—研究现状与未来展望 林仲旸摘要 微生物生态学常利用核糖体RNA作为一种分子技术来鉴定微生物种群，其中一种策略就是克隆从周围环境获得的PCR产物来检查微生物群落的多样性，而不需进行培养。虽然这种方法很成功，但却不适合用来研究微生物群落复杂的动力学，例如微生物群落对电解质的耐受，季节波动的影响，环境变化的影响。因此，基因指纹分析技术是一种更好的方法，在此我将展示当前基因指纹技术在微生物生态学的应用并展望未来的前景。 基因指纹分析技术的意义 微生物通常很小，外部特征也不显著，无法通过形态学去分类。 自然界中99%的微生物是无法被分离 。 为了对微生物多样性执行生态系统机能所发挥的作用更好地理解 ，一种能弥补传统微生物测定法的不足的技术是很必须的。 基因指纹分析技术基于各种独特的核苷酸物理分离片段，能描绘出微生物群落的结构轮廓。 最重要的是，这种方法能够同时分析多个样品，因此能够比较不同环境中微生物群落的遗传多态性，还能随时间变化研究单个群落的习性。 低分子量RNA指纹技术 该基因指纹技术的用于描绘低分子量RNA(5S 核糖体RNA；转运RNA)已有10年多了，这项技术通过直接从环境样品中提取总RNA，通过聚丙烯酰胺凝胶电泳进行分离。显影后可将图谱扫描然后储存在数据库中方便比对。 到目前为止，克隆16S rDNA的PCR扩增产物是检