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TET蛋白家族在人类肿瘤疾病中的作用 上海易毕恩生物技术有限公司 张亮 2018.11.15 1、TET家族DNA羟化酶的结构与功能 TET家族蛋白是一种依赖α-酮戊二酸( α-KG)和Fe2+而发挥催化活性的双加氧酶,在靠近C端的位置拥有1个催化结构域,该结构域具有3个金属离子( Fe2 + ) 和1个α-KG 的结合位点,催化结构域前还拥有 一 段富含半胱氨酸区( Cys-rich domain ) 。 TET家族蛋白是一种依赖α-酮戊二酸( α-KG)和Fe2+而发挥催化活性的双加氧酶。 α-KG和O2作为协同底物, 将一个氧原子连接到底物上形成羟基, 另一个氧原子加到α-KG上使得α-KG脱羧生成CO2和琥珀酸盐 。 TET蛋白介导DNA主动或被动去甲基化的机制提示DNA去甲基化的途径并非单一, 且其过程涉及多种蛋白的参与。然而无论后续步骤是经过脱氨基途径、碱基切除修复途径, 还是胸腺嘧啶糖基化酶切除途径, 都需氧化5-mC生成5-hmC进而完成一个完整的DNA去甲基化循环。可见, TET蛋白氧化5-mC生成5-hmC是整个DNA去甲基化过程的必需步骤。5-hmC作为去甲基化的中间产物参与DNA去甲基化的过程, 而TET蛋白则是调控DNA去甲基化的限制因子。 2、TET家族DNA羟化酶的在不同肿瘤中的作用 用免疫印迹对人结肠、肝、脑、肾、骨骼肌和肺的肿瘤组织与相应的正常组织进行对照分析,发现肿瘤组织中5-hmC的荧光信号显著降低。结果表明,人类实体肿瘤中存在着某种机制导致5-hmC水平降低。 TET家族基因和DNMT家族基因分别能催化DNA去甲基化和甲基化反应,因此TET家族和DNMT家族的基因表达对5-hmC水平有着至关重要的影响。通过对两个家族的基因表达分析,与正常对照相比,约50%(11/22)CRCs样本的TET1表达降低,这些TET1低表达的样本中有73%(8/11)伴5-hmC降低,再对5-hmC降低的样本进行DNMT表达的检测,发现这些样本中约88%(7/8) DNMT表达升高。TET2表达在肿瘤样本和正常对照中都非常低,而TET1低表达与TET3 mRNA降低密切相关。 在人的乳腺肿瘤、肝肿瘤、肺肿瘤、胰腺肿瘤和前列腺肿瘤中与周围正常组织相比 5hmC 的水平有明显的降低,而且在 5hmC 的水平降低的同时,三种 TET (TET1、TET2、TET3)蛋白 mRNA 水平也有降低,显示 TET 蛋白在肿瘤细胞5hmC 的水平降低机制中存在作用。 定量检测方法发现睾丸原位癌患者发生微分裂的 DNA 存在着低水平的 5hmC,而5hmC 是在 TET 蛋白的催化作用下产生的;通过免疫组化和免疫荧光的技术检测睾丸原位癌患者 TET1, TET2 表达,发现TET 蛋白的表达的缺失。 以上研究均显示,在肿瘤发生过程中,TET 蛋白表达发了变化,显示 TET 蛋白很可能成为行的肿瘤分子标志。 结论:在人多数肿瘤组织中与周围正常组织相比 5hmC 的水平有明显的降低,而且在 5hmC 的水平降低的同时,三种 TET (TET1、TET2、TET3)蛋白 mRNA 水平也有降低,显示 TET 蛋白在肿瘤细胞5hmC 的水平降低机制中存在作用。 * *
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