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- 2019-08-03 发布于天津
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2012年铜仁学院第二届数学建模赛
B 题: 单体型装配问题
国际人类基因组测序计划的完成,为全世界的科学家提供了一套精准的人类基因组序列图谱,为人类真正了解自身奠定的重要基础。同时,我们也惊奇的发现:任何两个不同个体的基因组序列至少有99.99%的碱基对是相同的,也就是说剩下的仅仅有0.01%的差异包含了遗传上的差异因素。
双倍体生物的基因组由一对染色体组成,一条来自父方,一条来自母方。单核苷酸多态性(SNP)是指染色体上的某些核苷酸位置,在这些位置上,不同个体的DNA 序列有多种取值。在SNP 位置上出现的核苷酸称为等位基因。一般地,在一个生物种群当中,出现在某个SNP 位置上的核苷酸只有两种,而不是四种(A, G, C, T)。正常型等位基因(出现频率较多的那个核苷酸)一般记为1,变异型等位基因(出现频率较少的那个核苷酸)一般记为0。位于一条染色体上某一区域的一组等位基因称作单体型。
SNP
SNP SNP SNP
染色体1 1 0 0 0 1 1 1 1 1 1 0 0 0 1 1 1 1 1 1 0 0 0 1 0 1 0 0
染色体2 1 0 0 0 0 1 1 1 1 1 0 0 0 0 1 1 1 1 1 0 0 0 1 1 1 0 0
单体型1 1
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