原核终止子读书笔记.docVIP

原核生物转录的终止——终止子 摘要：转录是基因表达调控的重要环节，终止子是DNA上的一类终止信号，当RNA Pol遇到DNA上的特殊终止信号，转录就会停顿，通过各种特殊方式从DNA上脱落，转录终止。终止子不受环境的影响，转录一旦起始，就一定走到底才发生终止作用。已知原核生物转录终止有两种模式：一种是依赖ρ（Rho）因子的，一种是不依赖ρ（Rho）的。非依赖ρ因子的转录终止：为强终止子，DNA上含有终止序列的特殊位点，即模板链上有富含GC的回文结构，由于GC之间是3个氢键，较稳定，因而当RNA聚合酶经过时不会拆开DNA形成的茎环结构，前行受到阻止。模板链上随后有多个连续的A，在RNA上转录成多个U，AU配对氢键弱，因而RNA易雨DNA分离，重新形成DNA双螺旋，RNA脱离。依赖ρ因子的转录终止：为弱终止子，不能形成茎环结构，当RNA Pol遇到若终止子后，RNA Pol停顿，转录停止，翻译开始，翻译完毕，核糖体脱落。Rho因子有ATP酶和解旋酶的活性，与RNA产物结合，使得RNA聚合酶与Rho蛋白都发生构象变化，DNA\RNA双链拆离，利于产物从转录复合物中释放。 关键词：原核mRNA；转录终止；强终止子；弱终止子 在转录过程中, R N Pas e 一旦开始转录, 酶沿着D N A 模板继续前进, 不断延长R N A链, 一直它遇到终止信号才停止。在终止点酶停止向生长的R N A 链上添加核普酸, 释放完成的产物, 而且酶从D N A 模板上脱落。终止作用要破坏R N A 一D N A 杂交体的全部氢键,成后D N A 双链再合拢。 提供转录停止信号的D N A 顺序, 称为终止子(t e r m 讯at or , 缩写为O ,在某些终止子中, 终止事件可以被专一性的辅助因子阻止, 辅助因子可以与R N Pa s e相互作用。 终止事件不是产生R N A 分子3’ 一末端的简单机制, 而是控制基因表达的一个机会。当酶与D N A 接合时(起始作用) 或从D N A 上脱落时(终止作用) 是接受特异调控的好时机。这种调控系统在起始与终止中有同等重要性。二者均需破坏氢键(在起始时D N A 的解链, 在终止时R N A 一D N A 的分离) , 而且二者都需要辅助蛋白与核心酶相互作用。实际上是通过改变酶的形式来完成, 这时酶从一种形式改变为另一种形式。 1. 终止子(t e r m in a to r ) 目前已知转录的终止过程与D N A 模板上的特异顺序有关。D N A 分子上终止转录的特殊信号, 称为终止子。目前在大肠杆菌中已经发现了二种不同类型的终止子, 根据R N Pa s e的终止作用是否需要附加因子来区别。核心酶在体外缺乏任何其他因子时, 在D N A 上的 某些部位可以终止转录, 这些部位称为不依赖p (r h o) 的终止子或简单终止子, 也有人称为强终止子(, tr o n g te r m in a to r )。另外一些需要p 因子帮助才能终止的部位, 称为依赖p 的终止子。也称为弱终止子(W e a k t e 1’m in a to r ) 。 所有原核终止子都含有一段回文顺序, 恰好在终止点的前边 。在每一种情况下, 回文结构由颠倒重复顺序组成, 被一个短的顺序隔开。R N A 内的颠倒重复顺序之间的碱基配对可以形成发夹结构。见图1 〔6 〕。 发夹结构对转录的作用是什么? 在R N A 产物中形成的发夹结构, 都引起聚合醇的速度减慢或终止R N A 的合成。在一个典型终止子中, 聚合酶的终止约60 秒(假如连续转录, 酶一分钟内大约移动2 , o oo b p ) 2.原核生物转录终止研究概述 1969年Roberts发现傅转录终止的蛋白质Rho(p)因子，此后将原核生物转录终止分为依赣与非依赖Rho因子两类型．转录产物碱基序列表明，非依赖Rh0因子转录出的RNA，3 一端都有一串寡聚U (4～lO个)．前方是富于GC碱基的反向对称(dyadsymmetry)区域 相对应的DNA区域就是终止位点。但转录终止信号在RNA丽不是DNA ． 反向对称医是茎环(stem-loop)二级结构 常出现于RNA分子中．功能十分广泛。就转录终止而言，茎环可使RNA聚合酶暂停 寡聚U和相应反意义链形成ru_dA的RNA-DNA杂化双链．rU—dA配对不稳定而利于转录产物从模板上分离”】．茎长至少6对碱基．寡聚U至少4个；茎和寡聚u越长．终止效率越高． 对Rho因子的研究兴趣集中在其ATP酶话性、与RNA相互结合及础 蛋白质的结构功能关系3方面。Rho因子含419个氨基酸，亚基分子量46094．以六聚俸存在“ ．分子中N一端31kDa是结合RNA的功能区。C端能结合4种NTP并将其水解，