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核酸扩增荧光定量法检测
SARS病毒实验手册
卫生部医药生物工程技术研究中心
中山大学达安基因股份有限公司
二零零三年五月
目 录
一、标本的采集、保存与运送
二、荧光定量PCR法检测SARS病毒标本前处理
三、FQ-PCR实验曲线基本参数含义以及结果分析标准程序
四、FQ-PCR检测SARS病毒报告发放标准程序
五、达安SARS病毒检测试剂的质检标准操作程序
六、FQ-PCR检测SARS病毒室内质量控制标准操作程序
附录1
SARS病毒核酸扩增(PCR)荧光检测试剂盒说明书
SARS病毒核酸扩增(PCR)荧光检测试剂盒说明书(for Lightcycler)
附录2
各种荧光检测仪的使用和校准
1、ABI PRISM 7000型核酸扩增荧光检测仪
2、LightCycler型核酸扩增荧光检测仪
3、Gene Amp 5700型核酸扩增荧光检测仪
4、低温离心机
附录3
实验室生物安全防护及消毒
附录4
广东省卫生厅关于临床试用非典病毒基因荧光PCR技术的通知
标本的采集、保存与运送
漱口液
取无菌生理盐水5ml盛装在15ml标准带盖密封一次性无菌塑料离心管内,采样时为提高病毒检出率,选择发病早期(最好5天以内)的病例,并且应在病人进食2小时后采集标本,期间尽量少喝水,采样时可让患者先咳嗽数声,然后用5ml无菌生理盐水漱口,漱口时让患者头部后仰,发出噢声,让采样液在咽喉部转动3~5秒,随后通过纸漏斗缓缓吐回离心管中。
标本应带冰(预先准备冰壶)在2小时内尽快送至实验室。标本至实验室后,应尽快进行处理及检测,如在24小时内可安排检测,标本可置4℃保存。如未能安排检测,则放-20℃保存,需要长期保存应置-70℃。
粪 便
使用清洁便盆盛装患者粪便,用灭菌竹签挑取含脓、血或粘液的粪便置于15ml标准带盖密封一次性无菌塑料离心管内。
标本应带冰(预先准备冰壶)在2小时内尽快送至实验室。标本至实验室后,应尽快进行处理及检测,如在24小时内可安排检测,标本可置4℃保存。如未能安排检测,则放-20℃保存,需要长期保存应置-70℃。
荧光定量PCR法检测SARS病毒标本前处理
漱口液
a)穿戴好隔离服等防护设备,启动全排Ⅱ级生物安全柜(以下简称生物安全柜)。待生物安全柜正常工作后,双手戴上第二层手套,从冰箱取出标本,在生物安全柜中将化验单和试管依次编号后,弃去外层手套。
b)双手换上新外层手套,用镊子(夹取灭菌物品专用)取出1.5ml灭菌离心管,对应标本编号,置于离心管架上。
c)向1.5ml离心管中加入500μl嗽口液标本或50μl阴性对照液,再加入等量浓缩液。在闭管情况下将离心管移出生物安全柜置于-20℃静置10分钟后,4℃ 12000转/分钟离心10分钟。
d)离心后标本转移至生物安全柜中去上清至剩余20~30ul。加入混匀后的RNA提取液A10ul,再用移液器加入400 μlRNA提取液B,在震荡器上震荡混匀,室温放置5分钟,然后闭管转移出生物安全柜6000转/分钟离心1分钟。
e)离心后标本转移至生物安全柜中去上清,留沉淀。加入400μl 用DEPC水配制的75﹪的预冷乙醇充分混匀,洗涤沉淀,关闭管盖。然后于生物安全柜外6000转/分钟离心1分钟,移回生物安全柜内去上清。相同方法再洗涤一次,吸干上清。然后离心管移至生物安全柜外65℃10分钟开盖烘干。
f)向烘干后的沉淀管中加入18 μl的反应液I,混匀,再加入2 μl逆转录酶,充分混匀,放入温箱,37℃45分钟逆转录。
g)逆转录后95℃3分钟高温灭活,瞬时离心(3秒),取5 μl上清立即点样上机。
h)收拾台面至准备状态,进行实验环境消毒灭菌。
粪 便
a)穿戴好隔离服等防护设备,启动生物安全柜。待其正常工作后,双手戴上第二层手套,从冰箱取出标本,在生物安全柜中将化验单和15ml带盖密封离心管依次编号。
b)向标号后的离心管中加入5ml灭菌生理盐水,用灭菌棉签挑取1g粪便置于离心管中,充分混匀。
c)标本转移至生物安全柜外3000转/分钟离心5分钟。同时另取15 ml带盖密封离心管编号。
d)在生物安全柜内取上清3ml转移至对应编号15 ml带盖密封离心管中。
e)双手换上新手套,用镊子(夹取灭菌物品专用)取出1.5ml灭菌离心管编号,置于离心管架上。
f)向1.5ml离心管中加入500μl粪便上清液标本或50μl阴性对照液,再加入等量浓缩液。在闭管情况下将离心管移出安全柜置于-20℃静置10分钟后,4℃ 12000转/分钟离心10分钟。
g)离心后标本转移至生物安全柜中去上清至剩余20~30ul。加入混匀后的RNA提取液A10ul,再用移液器加入400 μlRNA提取液B,在震荡器上震荡混匀,室温放置5分钟,然后闭管转移出生物安全柜6000转/分钟离心1分钟。
h)离心
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