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转化医学生物信息支撑平台管理系统开发可行性研制论证报告版本四川大学自动化系年月日系统开发名称转化医学生物信息支撑平台管理系统开发主要功能技术要求华西转化医学生物信息支撑平台管理系统符合中国医药生物技术协会生物样本库标准试行关于生物样本库的管理要求根据华西生物样本库硬件条件包括冰箱液氮罐等相应存储设备和临床科研的需求进行设计系统的基本功能包括样本管理设备管理耗材管理样本试验管理科研项目管理等全方位功能模块对样本设备耗材在全生命周期中进行过程管理监控和质量控制实现相关数据的系统化记录和管理对样本设备
转化医学生物信息支撑平台
管理系统开发
可行性研制论证报告
版本:0.1
四川大学自动化系
2016年6月17日
系统开发名称
转化医学生物信息支撑平台管理系统开发
主要功能技术要求:
华西转化医学生物信息支撑平台管理系统符合《中国医药生物技术协会生物样本库标准》(试行)关于生物样本库的管理要求,根据华西生物样本库硬件条件(包括冰箱、液氮罐等相应 存储设备)和临床科研的需求进行设计。
系统的基本功能包括样本管理、设备管理、耗材管理、样本试验管理、科研项目管理等全方位功能模块,对样本、设备、耗材在全生命周期中进行过程管理、监控和质量控制,实现相关数据的系统化记录和管理,对样本、设备、耗材的状态和使用情况进行实时监控。通过使用信息系统,能够帮助用户有效建立起统一的生物样本库信息管理平台,该平台能够符合本地管理、信息共享、合作利用等的临床科研需要。在此基础上,建立统一的数据存储体系和丰富的数据接口,实现与HIS、LIS、BIMS等系统数据库的数据融合,建立统一的数据管理与分析集成平台、生物数据分析系统以及专家系统,为预防人群相关疾病的发生并进行提前干预、新药研制等提供基础数据服务。
系统采用B/S模式为主、C/S模式为辅的混合模式、三层架构,使用MS SQL Server2008作为数据库管理系统,采用Java+Html5+CSS开发,主要功能均可在包含手机、平板电脑在内的智能终端以及台式机上使用。
系统包括系统设置、日志管理、设备管理、样品管理、耗材管理、临床信息管理、文档管理、数据中心、专家系统、试验项目管理等模块。此外,系统预留标准化数据接口,方便接入新的设备和外部数据库;预留编程接口,方便在系统的专家系统和数据分析中心中使用自定义算法。
目 录
TOC \o 1-3 \h \z \u 一. 系统开发的必要性 1
1. 系统开发的主要用途 1
2. 系统开发的理由 1
2.1 目的意义 1
2.2 系统需求 3
2.3 社会、经济效益分析 6
二. 系统开发的主要内容、关键技术、创新点与预期目标 7
1. 主要内容 7
1.1 系统设置 7
1.2 日志管理 8
1.3 设备管理 8
1.4 样品管理 10
1.5 耗材管理 12
1.6 临床信息管理 13
1.7 文档管理 14
1.8 数据中心 14
1.9 专家系统 16
1.10 试验项目管理 17
2. 关键技术 18
3. 创新点 20
4. 预期目标 21
三. 现有工作基础、条件和优势以及技术风险分析 22
1. 现有工作基础、条件和优势 22
2. 技术风险分析 22
四. 系统开发计划进度和分阶段目标 23
五. 系统开发的经费概算 27
转化医学生物信息支撑平台管理系统开发 单项论证
第 PAGE 26 页 共 NUMPAGES 30 页
系统开发的必要性
系统开发的主要用途
转化医学生物信息支撑平台管理系统是为了能方便有效地管理生物样本及相关信息所建立的具有搜集、保存、检索和分析功能的信息系统。
系统对临床标本供体、标本本体和生物治疗衍生物及其相关信息进行分类和系统管理。形成临床治疗和临床药物试验和随访的生物标本采集、临床治疗评估,科研问卷和科研结果一体化的动态工作模式,集成各模块数据,开发智能管理软件,打造信息共享平台,达到信息资源的集成化、模块化、自动化、网络化运行,经生物信息化分析反馈到决策层,使各独立的功能单元有机地整合,实现基础科研向临床医学转化信息管理的变革。
系统架构在数据库和WEB服务器信息设备基础上,主要基于生物信息学、计算机技术、人工智能等方法进行智能生物样本与生物信息方面的分析、存储、管理、搜索海量生物信息、为医学研究和治疗提供信息化、自动化、网络化的决策支撑。
系统开发的理由
2.1 目的意义
生物样本资源库作为一种为研究利用人体生物样本提供资源的贮藏室,已成为支持基因组学和个体化药物研究等的关键资源。但是临床及转化医学中新治疗方法的研发仅仅依靠储存大量的生物样本是不够的,还需要获取样本相应的临床、病理、影像、治疗、随访、知情同意、生活方式等信息,所以样本库行业急需建立一个健全的样本库信息管理系统追踪样本的生命周期进行全程有效追踪,获取从样本采集到处理、生理和临床信息注释、科研应用、最终到样本销毁的信息数据。
生物技术和计算机技术的快速发展为大规模收集如血液、尿液等人体生物样本、存储样本的相关医疗信息、大量的样本数据统计分析、生物样本信息资源库的信息化应用管理及不同地域间的生物样本信息资源库的资源交流提供了良好的平台。针对建立、统一、资源网络是国际样本库发展
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