植物表观遗传学 (2).pptVIP

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2019-08-17 发布于湖北
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植物表观遗传学 (2).ppt

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Acetyl Methyl Phosphoryl Ubiquitin De/Acetylation Methylation Phosphorylation Ubiquitination ADP-Rybosilation Swi/Snf complex, which, in vitro, uses the energy of ATP hydrolysis to disrupt histone-DNA interactions 组蛋白修饰作用 Transcription – Acetylation/Methylation DNA repair – H2A -Phosphorylation Mitosis – chromosomal arrangement Chromatin assembly – DNA replication Maintenance of CG DNA methylation MET1 HDA6 (HISTONE DEACETYLASE 6) DDM1 Maintenance of CNG methylation CMT3, KYP(KRYPTONITE) /SU(VAR)3-9 HOMOLOG 4 (SUVH4) AGO1 DsRNA AGO1 KYP CMT3 CNG Me CHH Me siRNAs DCL3 ~24bp TGS: RNA-directed DNA methylation Inverted DNA R Pol II Me Me Me MET1? DRM2 MET1 HDA6 CG Me DDM1 DNA RNA pol IV RDR2 Me Me Me CG CNG CHH AGO4 DRD1 DRM2 Specific DNA methylation loci in Arabidopsis Chan et al., Nat Rev Genet. 2005 6:351-60. (pathogen related) Wassilewskija strain Arabidopsis tryptophan enzyme phosphoribosylanthranilate isomerase (PAI) S15a promoter+ first exon PAI1-4: 350bp+ORF: hypermethylation hypomethylation hypomethylation 2 3 1 2 3 I top Top, V Middle, I Col hypomethylation F1 PAI2 gene is silenced X PAI3, no activity Melquist S, Bender J. Genetics. 2004 166:437-48. Genes Dev. 2003 17:2036-47. ATG 350 bp TAG WS, hypermethylation 2 3 I top Top, V Middle, I 1 F2 hypermethylated Low gene expression Some plants revert to hypomethylation status suvh4/hda6 cmt3 WS pai1 pai1 strain accumulates fluorescent tryptophan pathway intermediates, as well as displaying yellow-green leaf pigmentation, reduced size, increased bushiness, and reduced fertility. Superman（clark kent alleles ） (hypermethylated ) Suppressor ago4, cmt3, kyp, 在基因组水平上，DNA甲基化多发现于位于着丝粒及附近的DNA重复区、转座子。拟南芥多于5% 的表达基因，其启动子区域有DNA甲基化,大约1/3以上的基因在编码区有DNA甲基化,但生物学意义不清楚。一般编码区甲基化程度高的地方，基因转录水平也高。但启动子区域甲基化高的基因，转录水平较低，且多表现基因表达的组织特异性。拟南芥基因组水平上的甲基化组蛋白修饰 Histone modifications Overall – plant DNA is highly compacted by DNA-protein complexes to 10,000 to 50,000 -fold Even in interphase, DNA is highly structured Nuc