DNAstar软件包的使用1.pptVIP

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2019-09-06 发布于河北
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DNAstar软件包的使用1.ppt

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DNAstar软件包的使用1

What is bioinformatics? Bioinformatics is: driven by the generation of data, moderated by hardware and analysis methods 生物信息的开发和应用以核酸蛋白质等生物大分子为主要研究对象以信息、数理、计算机科学为主要研究手段以计算机网络为主要研究环境以计算机软件为主要研究工具对序列数据进行存储、管理、注释、加工对各种数据库进行查询、搜索、比较、分析构建各种类型的专用数据库信息系统研究开发面向生物学家的新一代计算机软件 Examples of Bioinformatics Database interfaces Genbank/EMBL/DDBJ, Medline, SwissProt, PDB, … Sequence alignment BLAST, FASTA Multiple sequence alignment Clustal, MultAlin, DiAlign Gene finding Genscan, GenomeScan, GeneMark, GRAIL Protein Domain analysis and identification pfam, BLOCKS, ProDom, Pattern Identification/Characterization Gibbs Sampler, AlignACE, MEME Protein Folding prediction PredictProtein, SwissModeler Five websites that all biologists should know NCBI (The National Center for Biotechnology Information; / EBI (The European Bioinformatics Institute) http://www.ebi.ac.uk/ The Canadian Bioinformatics Resource http://www.cbr.nrc.ca/ SwissProt/ExPASy (Swiss Bioinformatics Resource) http://expasy.cbr.nrc.ca/sprot/ PDB (The Protein Databank) /PDB/ DNASTAR软件包版本 5.03版本(适合win98/Me) EditSeq、GeneQuest、MapDraw、MegAlign、PrimerSelect、Protean、SeqMan 5.08版本(适合各个系统) EditSeq、GeneQuest、MapDraw、MegAlign、PrimerSelect、Protean、SeqManⅡ 6.**版本(适合WinXP/Win2000)(含6.00/6.13版本) EditSeq、GeneQuest、SeqBuilder、MegAlign、PrimerSelect、Protean、SeqManⅡ 7.**版本(适合WinXP及以上版本)(含7.0/7.1/7.2版本) EditSeq、GeneQuest、SeqBuilder、MegAlign、PrimerSelect、Protean、SeqMan pro 8.0版本(适合Windows? Vista? and XP ) EditSeq、GeneQuest、SeqBuilder、MegAlign、PrimerSelect、Protean、SeqMan pro EditSeq Edit and import sequences and annotations Translate, back-translate and reverse complement sequences Locate ORFs and create annotations Cut/paste sequence with inclusive annotations EditSeq included with all systems GeneQuest Discover and annotate genes Predict coding regions and splice sites Locate repeats, patterns, or areas matching known sequence data Simulate agarose gel electrophoresis MapDraw Locate restriction sites Create six types of l