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Revman,Stata,Meta-disc在诊断试验准确性(DTA)系统评价中的应用
文献数据摘自《ProGRP与NSE对小细胞肺癌诊断价值的meta分析》
文中提取数据
作者
国家
研究方法
盲法
研究对象
金标准
病例数
阳性界值(pg/ml)
TP
FP
FN
TN
a
b
a
b
a
b
a
b
a
b
Schneider
德国
前瞻
--
连续
病理
298
29.1
9.6
35
38
18
35
16
13
229
212
Stieber
德国
回顾
--
--
病理
314
38.3
11.9
41
39
9
44
46
48
218
183
Molina
西班牙
前瞻
--
连续
病理
802
50
25
134
114
79
50
41
61
548
577
Nissan
以色列
前瞻
--
连续
病理
162
48
22
29
18
6
12
8
19
119
113
Shibayama
日本
--
--
连续
病理
359
49
7.5
74
49
11
10
40
65
234
235
Lamy
法国
回顾
是
--
病理
245
53
17
117
110
2
4
29
36
97
95
Takada
日本
回顾
是
连续
病理
326
33.8
10.6
73
63
22
43
28
38
203
182
Yamaguchi
日本
--
是
连续
--
602
50
8,1
80
79
6
26
47
48
469
449
Sun
中国
--
--
--
病理
100
50
16.3
25
19
6
8
9
15
60
58
Yang
中国
--
--
--
病理
144
46
16.3
46
40
9
16
17
23
72
65
注: 表中 10 个原始研究均使用酶联免疫吸附测定法检测阳性界值; TP= 真阳性数; FP= 假阳性数; FN= 假阴性数; TN= 真阴性数a:ProGRP,b: NSE
Revman5.2
新建诊断试验准确性(DTA)系统评价模板
添加所有纳入研究
此处对每篇文献QUADAS2质量特征进行描述,以便探讨异质性来源及作表图
数据分析里面添加所要研究的待评价诊断试验
可计算相关指标(似然比及诊断比值比和单独在干预系统评价里面作森林图)
添加分析里面制作SEN和SPE森林图及SROC曲线,可对数据进行重新制定
设置参数
若用户对上图窗口中的统计分析显示的结果不满意,可点击右上角的属性按钮); 或依次展开树形目录分支Data and Analyses→Analyses→ProGRP,选中ProGRP并单击右键,选择Properties … ,弹出属性设置对话框。在图对话框中,可对统计指标(General)、SROC图、森林图和异质性来源的参数进行设置,并点击Apply使其生效,见下图。
亚组分析(假如,原文没做)
QUADAS-2偏倚表(图)制作
异质性来源
在DTA系统评价里面不能直接进行似然比、诊断比值比的森林图以及各指标漏斗图制作,但可以改变四个表数据模式或直接计算相关指标,添加入干预性系统评价模板中进行制作及查看异质性、发表偏倚(漏斗图)。
Stata12
一 拟合双变量混合效应模型:midas命令
1.计算所有诊断试验统计学指标(敏感度、 特异度、 似然比、 诊断比值比等) 及异质性检验统计量:
2. 绘制敏感度、 特异度森林图:
3. 绘制 ROC 曲线图:
4. 绘制漏斗图, 识别发表偏倚:
STATISTICAL TESTS FOR SMALL STUDY EFFECTS/PUBLICATION BIAS
5. 绘制似然比森林图:
6. 绘制诊断比值比森林图:
7.绘制验前概率、 验后概率图:
验前概率=患病率,验后概率=验前概率*似然比
二 拟合HSROC模型:metandi命令
1.合并统计量命令
2.绘制SROC曲线
Meta-disc14
表2 Meta-Disc软件的主要功能
主要功能
说明
Describing primary results and exploring heterogeneity
描述原始结果和探索异质性
Tabular results
将结果以表格形式列出
Forest plots(sensitivity,specificity,LRs,dOR)
以森林图形式显示灵敏度、特异度、似然比和诊断比值比
ROC plane scatter-plots
ROC平面散状图
Cochran-Q,Chi-Square, Inconsistency index
判断研究间异质性
Filtering/subgrouping capacities
亚组分析
Exporing Thr
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