原创力文档- 1、原创力文档（book118）网站文档一经付费（服务费），不意味着购买了该文档的版权，仅供个人/单位学习、研究之用，不得用于商业用途，未经授权，严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等，侵权必究。。
- 2、本站所有内容均由合作方或网友上传，本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺！文档内容仅供研究参考，付费前请自行鉴别。如您付费，意味着您自己接受本站规则且自行承担风险，本站不退款、不进行额外附加服务；查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档，您可以点击 这里二次下载。
- 3、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等，请点击“版权申诉”（推荐），也可以打举报电话：400-050-0827(电话支持时间：9:00-18:30)。
查看更多
第 5 1 卷 第 11 期 林 业 科 学 Vol. 5 1 ，No. 11
2 0 1 5 年 11 月 SCIENTIA SILVAE SINICAE Nov ． ，2 0 1 5
doi :10 ．11707 / j ．100 1-7488 ．20 15 1106
杉木转录组 SSＲ 挖掘及 EST-SSＲ 标记规模化 开发
文亚 峰1 韩文军2 周 宏3 徐 刚标2
(1． 中南 林业科 技大 学风 景 园林学 院 长 沙 4 10004 ; 2 ． 中南 林业科 技大 学林学 院 长 沙 4 10004 ;
3 ． 广 东省韶 关 市 林业 局 韶 关 5 12000 )
: 【 】 SSＲ 、 ，
摘 要 目的 为解 决杉 木 标 记 数量 不足 已开发的位 点多态性较 差 等 问题 以杉 木 转 录 组测序 数据 为基
， PCＲ SSＲ ， EST -SSＲ ， 。 【 】
础 结合 多重 技术 批 量 挖掘 规 模 化 开发 位 点 为 杉 木 分 子 遗 传 学 研究奠定 良好 基 础 方 法
杉 木 转 录 组序 列 数据 (Accession : SＲX 15 1872 ) 从 NCBI 的 SＲA 数 据 库 下 载 。利 用 CLC 和 CMiB 软 件 批 量 挖 掘 SSＲ
; PCＲ (multiplex-PCＲ) SSＲ 。 【 】
位 点 利 用 四色 荧 光 标 记 通 用 引物多重 技术 实现 标 记 的规 模 化 开发 结 果 杉 木 转 录
de novo assembly 35 633 contigs ， 3 1. 5 Mb ， 155 bp ， 23 794 bp ，
组 序 列拼 接 共 得 到 个 总长 度 其中最小 拼 接 长 度 最 大
884 bp 。 2 156 SSＲ ， 1 822 contigs ， 256 contigs 1 SSＲ
平 均 长 度 得 到 个 位 点 分布于 个 中 其中 个 中包 含 个以 上 位
， SSＲ 118 ，SSＲ 68. 4 / Mb 。 SSＲ (motif) ， SSＲ
点 复合 型 数量 为 个
文档评论（0）