蛋白质和蛋白质组学.pptVIP

蛋白质组(proteome)：由一个细胞或一个组织的基因组所表达的全部相应的蛋白质。 蛋白质组学(proteomics)：是研究蛋白质组或应用大规模蛋白质分离和识别技术研究蛋白质组的一门学科。 人类基因组计划的完成3-4万个基因，30亿对碱基 基因组是唯一的，但蛋白表达是变化的 后基因组—蛋白质组的研究是21世纪生命科学的主要任务（Wilkins MR et al 1997) 1994年Williams提出测定有机体的基因组所表达的全部蛋白 1995年Wilkins正式提出Proteome一词由一个细胞或一个组织的基因组所表达的全部相应的蛋白质，而研究蛋白质组功能为蛋白质组学（Proteomics）  一、亚细胞水平的遗传物质—染色质 1、DNA的分子结构和特征 2、染色质的分子组成和结构 3、染色质的结构与基因表达 二、基因、基因表达调控 1、基因的认识与发展 2、真核基因组的结构特点 3、基因表达调控 三、蛋白质与蛋白质组学 1、基因组与蛋白质组比较 2、蛋白质组学的研究方法 * * 蛋白质和蛋白质组学 蛋白质组及蛋白质组概念的提出 (一) 基因组与蛋白质组比较 基因组 转录组 蛋白组 The study of proteins expressed by genomes Completion of the sequencing of the 1st draft of human genome indicates there are approximately 250,000 proteins in the human genome Only 2-5% of proteins in human genome have been identified Expression proteomics (表达蛋白组学) The study of global changes in protein expression Proteomics Cell-map proteomics （细胞图谱蛋白组学） The systematic study of protein-protein interactions through the isolation of protein complexes (二) 蛋白质组研究的主要方法 双相电泳技术（two dimensional electrophoresis gel 2D） “双向”高效柱析法: 分子筛柱层析 反向柱层析 质谱分析 ( MS): 辅助激光解析/离子化(matrix- assisted laser disorption / ionization) ; 电喷雾离子化（electrospray ionization ESI） 生物信息学 蛋白组研究的三个主要步骤： Separation of individual proteins by 2-D polyacrylamide gel electrophoresis (2-D PAGE) Identification by mass spectrometry or N- terminal sequencing of individual proteins recovered from the gel Storage, manipulation, and comparison of the data using bioinformatics Sample Prep 2-D GELS MASS SPEC MALDI-TOF Spot Cutter Protein Digest MALDI Spotting Sample SWISS-PROT/ TrEMBL ESI MS/MS Imaging D/BASE PepSeq 蛋白组学研究过程 SWISS PROT/ TrEMBL MicroMass ABI Bruker 样品 样品制备 2维电泳 纯化和点样 质谱测序 数据库分析 成像 双向电泳技术 1975年，O`Farrell et al 发明了双向电泳技术。 能检测到3000-4000种总蛋白，最大可达到一万种 一个细胞有5000-6000种不同蛋白，人体有250种细胞，每 个细胞表达300-400种自身特有蛋白 质谱分析(MS): 分类：辅助激光解析/离子化电喷雾离子化 原理：样本分子离子化后,根据不同离子间质荷比 (m/e )差异,分离样本,确定分子量 介质辅助的激光解吸/离子化 生物信息学 生物信息学在基因组学/蛋白质组学的研究中起重要作