第五章蛋白质组学.pptVIP

重点 蛋白质与蛋白质组学的概念 难点 二维凝胶电泳、酵母双杂交等技术的原理与方法 了解 蛋白质组学在医学中的应用 蛋白质组学研究背景 1.基因研究是20世纪生命科学的主线 1953年，DNA双螺旋结构的提出 1954年，“中心法则”的问世 20世纪90年代，全球性基因组计划尤其是人类基因组计 划（HGP）的大力推进 2000年6月，HGP计划完成 蛋白质组学研究背景 2.“后基因组时代”（postgenome era） 功能基因组学（functional genomics)成为研究的重心，蛋白质组学（proteomics）则是其“中流砥柱”。 蛋白质组(proteome)： PROTEOME = PROTE in +genOME Proteins expressed by a genome. 是指“特定细胞、组织乃至机体作为一个生命单元中所有蛋白质的集合，即生命体中携带的基因信息在某一时段所表达的全部蛋白质。 人类蛋白质组学研究进展 2001年成立国际人类蛋白质组组织（HUPO），2003.12.15启动两个首批行动计划 1.人类肝脏蛋白质组计划（HLPP）由中国军事医学科学 院副院长贺福初院士领导，16国80多个实验室参加。 中国第一次领导重大国际协作计划。 2. 人类血浆蛋白质组计划（HPPP）由美国科学家牵头， 13国47个实验室参加。 二维电泳的优点与缺陷 优点： 能溶解大量蛋白质并进行定量，具有高通量、重复 性好、敏感性较高等特点。 缺点： 1.蛋白表达水平的差异较大，一些低丰度蛋白不易检 测。 2.分辨率不能满足蛋白质组学研究的需要。 3.对极酸极碱性和疏水性膜蛋白的分离效果不佳。 Sample Inlet Ionization Mass Analyzer Mass Sorting (filtering) Ion Detector Detection Ion Source Sample/Matrix dried on MALDI Plate (Autoloader Cassette) Detect ions Forms ions (charged molecules) Sort Ions by Mass (m/z) 质谱的基本组成元件 Vacuum Envelope Relative Abundance m/z 1000 2000 Mass Spectrum Data System 基本步骤： 1.样品离子化 2.根据荷质比不同分离离子 3.检测每种质量离子的数目 4.收集处理数据得到质谱图 * * 第 五 章 蛋 白 质 组 学 (Proteomics) 医学检验系临床生化教研室 周 琳 结构基因组学时代 转录组学 蛋白质组学 代谢组学 表型组学 相互作用组学 功能基因组学 蛋白质组学是后基因组学时代研究的中心，而以阐明生物体内蛋白质表达模式与功能模式为目标的蛋白质组学成为功能基因组学研究的重要内容之一。 第一节 蛋白质组及蛋白质组学基本概念 什么是蛋白质组？ 1.对应于基因组的所有蛋白质构成的整体， 不是局限于一个或几个蛋白质。 2.同一基因组在不同细胞、不同组织中的表 达情况各不相同 。 3.在空间和时间上动态变化着的整体。 蛋白质组 Genome=static composition Proteome = highly flexible composition Identical Genome – but different looks? proteome comparison 蛋白质组与基因组的联系与区别 蛋白质组学（proteomics）： 以蛋白质组为研究对象，分析细胞内动态变化的蛋白质组成成分、表达水平与修饰状态，了解蛋白质之间的相互作用与联系，在整体水平上揭示蛋白质功能与细胞生命活动规律。 什么是蛋白质组学？ 表达蛋白质组学（expression proteomics)： 即把细胞、组织中的蛋白，建立蛋白定量表达图谱，观察某种细胞或组织中蛋白质的整体表达, 并分析不同情况下表达图谱的变化。 蛋白质组学的分类与研究内容 细胞图谱蛋白质组学（cell－map proteomics）：即确定蛋白质在亚细胞结构中的位置；通过纯化细胞器或用质谱仪鉴定蛋白复合物组成等，来确定蛋白