生物芯片分析教学内容.ppt

生物芯片(Biochip);本章提纲;;生物芯片分析基本流程;建立;;第二节 生物芯片的分类;一般分类;;第三节 基因芯片 ——基本原理、流程与应用;本节内容提要;简介;基因芯片发展历史;基因芯片;基因芯片的原理;核酸杂交;基因芯片的密度：100-1 million DNA 探针/1cm2;基因芯片流程;实验流程;;;基因表达情况的定量测定;基因芯片分类;Comparison of DNA Chip Technologies;基因芯片技术的类型;;两类主流的DNA芯片;(1) cDNA microarrays;Robot spotter;差异表达基因的筛选;;Genes;;;DNA chips的制备：Affymetrix photolitography;点样后的Gene chip;总结;基因芯片的实验流程;2. 图像处理与数据标准化;图像处理;基因表达量的定量;Microarray: 误差的来源;Microarray: 误差的来源;;数据标准化;3. 基因芯片的数据分析;(1) 差异表达基因的分析;统计学分析;P-value: 学生分布;P-value: 学生分布;Multiple Comparisons;False Discovery Rate (FDR);(2) 基因共表达分析;没有相关性？;基因相关性分析;Pearson相关系数;(3) 基因表达数据