生物信息学资源检索分析.pptVIP

（一）BOND BOND是生物分子网络数据库，创建于2005年，由Unleashed Informatics公司管理和维护。 主要收录生物分子及其蛋白质序列、结构和相互作用等数据，其中生物分子包括蛋白质、DNA、RNA、配基、复合体、基因、光子（photon）等。 BOND集成了多个重要数据库，如BIND（生物分子相互作用网络数据库)、SMID（小分子相互作用数据库）、Genbank、GO（基因本体）、OMIM、conserved domains（保守功能域）、交叉参考数据库、完整基因组等。 网址：/ * BOND主页 * （二）DIP DIP专门存放实验确定的蛋白质之间相互作用的数据，既包括经典实验手段确定的蛋白质相互作用，也包括高通量实验手段确定的蛋白质相互作用数据。 数据要经过人工审核和采用计算方法自动验证后加入数据库。数据的自动验证有3种指标，即EPR Index、PVM Score和DPV Score。 在目前缺乏蛋白质相互作用数据金标准的现实情况下，DIP为采用计算的方法自动验证高通量技术产生的蛋白质相互作用数据做了开拓性的工作。 DIP还利用XML技术专门开发了一种用来存放和交换蛋白质相互作用数据的xin格式。 网址： / * （三）STRING STRING不仅存贮实验确定的蛋白质相互作用数据，而且还存贮预测的蛋白质相互作用数据，并对各种预测方法的准确性给