生物信息学第2章.pptVIP

* No tree building in BLOSUM * This step is similar to BLOSUM * * * * Calculate scaled original residue?residue specific mutation rate. Rebuild mutation frequency matrix for 1 evolutionary period. * Add up to 1 at every row. Pr(mutate to j| was i) * * * * Introduce the names of the two sets of most commonly used scoring matrices for protein sequences * * BLAST软件包实际上是综合在一起的一组程序，不仅可用于直接对蛋白质序列数据库和核酸序列数据库进行搜索，而且可以将检测序列翻译成蛋白质或将数据库翻译成蛋白质后再进行搜索，以提高搜索结果的灵敏度。 BLAST程序检测序列和数据库类型 程序名 检测序列 数据库类型 方 法 Blastp 蛋白质 蛋白质 用检测序列蛋白质搜索蛋白质序列数据库 Blastn 核酸 核酸 用检测序列核酸搜索核酸序列数据库 Blastx 核酸 蛋白质 将核酸序列按6条