微生物分子生态学技术在文物保护中应用的进展.docVIP

文物保护与考古科学SCIENCES OF CONSERVATION AND ARCHAEOLOG 文物保护与考古科学 SCIENCES OF CONSERVATION AND ARCHAEOLOGY Vol． 24，No． 3 Aug，2012 第 24 卷 第 3 期 2012 年 8 月 文章编号: 1005-1538( 2012) 03-0108-04 ·知识介绍· 微生物分子生态学技术在文物保护中应用的进展 王亚丽 ( 广东省博物馆，广东广州 510623 ) 摘要: 微生物分子生态学技术近年来在文物保护研究中得到了广泛的应用，已经成为控制文物被微生物侵害的一 个不可或缺的工具。本研究较系统地总结了国内外利用微生物分子生态学技术进行文物保护研究的进展，为更有 效防治微生物危害侵蚀文物，进而长久的保存文物提供理论支持。 关键词: 微生物; 分子生态技术; 文物保护 中图分类号: K877; Q938． 1; 文献标识码: Q89 A 培养微生物，甚至取样分析也比传统的方法需要的 样品量少，能够以可培养及不可培养的所有的微生 物为研究对象，以微生物的 DNA 研究为手段，揭示 微生物群落结构及遗传多样性，并显示出微生物种 群的动态变化。为更好地研究和利用这些资源奠定 基础。近年来，分子微生物生态学技术作为一种新 方法开始在文物保护中应用，并且受到越来越多国 内外专家学者的重视，并取得了很多进展［3 ～ 5］。 引 言 0 微生物种类繁多，它们具有代谢能力强、代谢方 式多样、易变异、繁殖快的特点，能够适应各种各样 的生活环境，因此广泛分布于自然界中，形成了独特 的微生物生态系统。微生物直接或者间接地影响人 类的生活，对文物也具有相当大的危害。无论是南 半球或是北半球，无论是密藏在地上或是深埋于地 底，都难逃微生物的侵害，至于暴露在地面的一些古 建、石窟、壁画等文物被微生物侵害的现象更是屡见 不鲜，因此微生物的防治工作一直是困扰文物保护 界的难点之一。只有详细鉴定微生物种属、了解不 同环境条件下的微生物种群结构、代谢方式，才能更 有效地防治微生物的危害侵蚀，进而长久地保存文 物，永传后世。 早期主要是应用传统的微生物培养技术分离培 养损害文物的微生物，依据微生物的形态及生理生 化特征对其进行鉴别分类，然后进行防治修复。但 由于培养条件、营养限制、失去生态位等因素，微生 物在常规条件都是不可培养或难培养的，据估计能 培养的大约 只 占 1% ［1］，这也限制了文物 中 菌 种 的 分离鉴定研究。随着分子生物技术的飞速发展，科 学家们将分子生物学实验技术应用于微生物生态学 研究领域进而发展形成一门交叉学科———分子微生 物生态学［2］，这种技术不需要利用传统的方法分离 1 16S rDNA /18S rDNA 鉴定菌种在文物保 护中的应用 基 于 细 菌 16S rDNA 和 真 菌 的 18S rDNA 的 高 度保守型，设计通用引物，扩增出特异性的片段，进 行微生物分类鉴定是现代研究中常用的微生物分子 鉴定方法。这种方法在分子微生物系统学、微生物 的分类鉴定等研究方面作出重要贡献。原理是微生 物中的 rRNA ( 小亚基核糖体核酸 ) 具 有 高 度 保 守 性，尤其是细菌中的 16S rRNA 和 真 菌 中 的 18S rRNA，因此常通过比较 16S rRNA /18S rRNA 的序列 差异来揭 示 菌 种 之间差异以及分类鉴 定［6］。由 于 rRNA 直接由 rDNA 转录过来，因此常用 16S rDNA / 18S rDNA 序列两端非常保守的区域作为引物进行 PCR 直接扩增 16S rDNA /18S rDNA，可 以 达 到 同 样 的效果。一般认为，16S rDNA /18S rDNA 序列同 源 性小于 98% ，可 以 认 为属于不同的种，同 源 性 小 于 收稿日期: 2011 -03 -20 ; 修回日期: 2011 -09 -28 作者简介: 王亚丽( 1978 —) ，女，中国科学院南海海洋研究所博士毕业，专业环境微生物学，现于广东省博物馆从事文物保护研究工作。 E-mail: gzmwyl@ 126 ． com electrophoresi electrophoresis，DGGE) 能够把长度相同但是核苷酸 序列不同的 DNA 片 段 分 辨 开，是 20 世 纪 80 年 代 初期 Lerman 等发明的一种检测 DNA 片段中点突变 的技术，分辨率可达到一个核苷酸。Myuzer［11］ 等于 1993 年首次将这项技术应 用于微生物的群落结构 93% ～ 95% 可以认为属于不同属。这种鉴定方法可 以从样品中直接提取、分析，比较其序