第十章数量性状遗传2008.pptVIP

浙 江 大 学 遗传学第五章 第十章 数量性状遗传 第一节 群体的变异 第二节 数量性状的特征 第四节 遗传参数的估算及其应用 第五节 数量性状基因定位 三、 复合区间作图法(composite interval mapping，CIM)： 　　Zeng(1993)提出了把多元线性回归与区间作图结合起来的 CIM方法。 　　要点：检测某一特定标记区间时，将与其它QTL连锁的标 记也拟合在模型中以控制背景遗传效应。 　　CIM法的遗传假定：数量性状的表现型变异受搜索的一对 基因的遗传效应（GQ，固定效应）和与其它QTL连锁的分子标 记遗传效应（GM，固定效应）以及随机效应控制。 　　遗传模型是： 　　其中遗传效应包括QTL效应和分子标记效应。 　　采用类似于区间作图的方法 ? 可获得各参数的最大似 然估计值 ?计算似然比，绘制各染色体的似然图谱?根据 似然比统计量的显著性，推断QTL的位置。 　　QTL效应则可由回归系数的最大似然估计值推断。 ⑴. 优点： 　①. 假如不存在上位性和QTL与环境互作，QTL的位置和效应的 　　　估计是渐近无偏的； 　②. 充分利用整个基因组的标记信息，背景遗传效应控制较好， 　　　作图精度度和效率提高。 ⑵. 问题： 　①. 不能分析上位性及QTL与环境互作等复杂的遗传效应； 　②. 需为检验的区间开辟一个窗口，但窗口大小不易确定。