应用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱_百替生物.docVIP

应用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱 源后衰变技术鉴定蛋白质 项目完成单位：国家生物医学分析中心 项目完成人：王杰杨松成吴胜明王红霞魏开华张学敏 摘要目的：应用PSD技术结合数据库检索鉴定2DE胶上的蛋白质斑点。方法：用已知多肽（ACTH）18~39肽段和TPA被胰酶降解后的1个肽段建立了PSD-MALDI-TOF-MS方法。结果：2DE分离后胶上的2个未知蛋白质斑点应用已建立的PSD-MALDI-TOF-MS法分别被明确鉴定为40SribosomalproteinS12和dnaKsuppressorprotein。结论：PSD技术在蛋白质组学研究中有较大的应用前景。 关键词蛋白质组学；源后衰变；基质辅助激光解析电离飞行时间质谱；肽质量指纹谱；多肽测序 一、前言 蛋白质组学是当前生命科学研究的前沿领域。对蛋白质快速、准确的鉴定是蛋白质组学研究中必不可少的关键性的一步[1]。 采用MALDI-TOF-MS测得肽质量指纹谱（PMF）在数据库中查询识别的方式鉴定蛋白质，是目前蛋白质组学研究中普遍应用的最主要的鉴定方法。但是，由于PMF鉴定结果的可靠性受诸多因素的影响，使得部分鉴定结果往往不是十分明确，特异性不高。多肽的氨基酸序列匹配被认为是特异性最好的鉴定方法。在蛋白质组学研究中，利用质谱测序一般采用两种方式：一种是利用串联质谱（MS/MS）测序；另一种是利用源后衰变（PSD）技术测序。