第02讲 核苷酸数据库.ppt

显示比对区域的框图 BLAST结果（1-2） BLAST结果（1-3） 被搜索到的序列信息 BLAST结果（1-4） 比对结果 BLAST结果（1-5） BLAST命中序列的系统进化树 BLAST操作流程总结 1.登陆blast主页 /BLAST/ 2.根据数据类型，选择合适的程序 3.填写表单信息 4.提交任务 5.查看和分析结果 其他的序列相似性搜索工具 －FASTA FASTA算法是由Lipman和Pearson于1985年发表的（Lipman和Pearson，1985）。 EBI提供FASTA服务。 FASTA对数据库的每一次搜索都只有一个最佳的比对，一些有意义的比对可能被错过。 http://www.ebi.ac.uk/fasta33/ 帮助信息 各个参数选项 填入搜索序列 向GenBank提交序列 * GenBank投递序列工具 BankIt (网上投递) 适于少量的、注释简单的序列投递 Sequin (本地投递;软件) 适于大量的、复杂的序列投递 可投递变异、种系发生、群体数据集 图形界面操作 选项多、功能强 可向GenBank, EMBL, DDBJ中的任一数据库投递 * BankIt（1） 注册 新提交任务 * BankIt（2） 联系人信息 * BankIt（3）