OLEX高级使用教程-拓扑-螺旋轴-画通道.pptVIP

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  • 2019-10-25 发布于湖北
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OLEX高级使用教程-拓扑-螺旋轴-画通道.ppt

保存文件----res 把res文件用记事本打开,添加原子名称,个数,及坐标。 原子坐标添加方法如下,完毕后保存。 用OLEX打开保存的res文件 修改分子间距,使添加的两个原子连接起来 结果如下图所示,通过改变原子和键的大小,得到合适的比例 结果保存为cry和jpg格式 如何添加通道? 方法与添加螺旋轴类似 记录添加原子坐标—保存为res格式 把res文件用记事本打开,添加原子名称,个数,及坐标。 为了使构筑通道,我们必须添加多个原子,通过添加更多的均一的原子坐标,方法与前面类似,再调节原子大小,得到所需的图片。 OLEX软件 使用小结 一般文件 cif, res, cry 的打开方法 mercury, OLEX, xp,wingx( Platon)等软件 用途一 OLEX软件 进行拓扑分析 打开res文件的软件 mercury, OLEX, xp,wingx 要使整个结构进一步拓展的话, 游离的客体分子可以删去, 删减原子一定要在BS状态下。 根据a,b,c 的轴长选择合适的数字 再点Fragments按钮下拉框,选generate钮,出现如上图 勾上’link change’—A from 最后边一个数可以选大点(如3or 4) 也可以选上’remove hydrogens’----OK 再点network--

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