分子模拟实验实验报告化学反应模拟.docxVIP

分子模拟实验作业 一、实验部分 10.1热力学参数的计算 10-1-1 计算甲基自由基（?CH3）的生成焓（实验值35kcal/mol）和生成自由能的计算（采用B3LYP/6-31G(d)理论方法） = 1 \* GB3 ①优化. CH3结构，得到总能量： ------------ GAMESS Interface ------------ Model: Untitled-1 GAMESS Job: Minimize (Energy/Geometry) B3LYP/6-31G(d) Finish @ energy = -24977.625963 Kcal/Mol E（CH3.）=-24977.6kcal/mol = 2 \* GB3 ②计算振动频率（run frequency），在输出文件中找到： 零点能： ZPE=18.6 kcal/mol 焓： H=21.2 kcal/mol 对焓进行零点能的修正： H298K-H0K= (21.2-18.6)kcal/mol=2.6 kcal/mol = 3 \* GB3 ③从输入文件中找到熵的数据： 熵 S= 50.4 cal/(mol.K) = 4 \* GB3 ④用同样的理论方法计算C原子和H原子的能量： E（C）= -23734.5 kcal/mol E（H）= -311.8 kcal/mol = 5 \* GB3 ⑤根据热力学公式，计算绝对零度（0K）下CH3·的生成焓： = 6 \* GB3 ⑥ 298K时的生成焓，根据以下公式计算： = 7 \* GB3 ⑦根据下列公式计算298K下时的自由能： 生成焓的计算结果35.1kcal/mol与实验值35kcal/mol相比符合较好。 10.2优化搜索过渡态 1、CH3CF3 HF+CH2CF2 = 1 \* GB3 ①过渡态的猜测和优化 = 2 \* GB3 ②过渡态的确认 1A 1A 2A 2A 3A 3A 4A 5A -1868.3 273.4 369.8 424.2 490.8 495.0 640.7 789.2 只有一个虚频 = 3 \* GB3 ③反应能量途径 Mopac/PM3计算的CH3CF3 HF+CH2CF2反应的能量途径 括号内数据表示相对于反应物的能量（单位：kcal/mol） 2、氢抽提反应CH4+.OH .CH3+H2O = 1 \* GB3 ①过渡态猜测和优化 = 2 \* GB3 ②过渡态确认 1 2 3 4 5 FREQUENCY: 3181.41 I 94.82 29.45 21.44 12.06 只有一个虚频 = 3 \* GB3 ③反应能量途径 Mopac/PM3计算的 CH4+.OH .CH3+H2O反应的能量途径 括号内数据表示相对于反应物的能量（单位：kcal/mol） 3、乙醇脱水反应 CH3CH2OH H2O+CH2CH2 = 1 \* GB3 ①过渡态猜测和优化 = 2 \* GB3 ②过渡态确认 1A 2A 3A 4A 5A 6A 7A 8A -1359.5 272.1 525.2 685.0 739.3 837.7 871.6 964.4 只有一个虚频 = 3 \* GB3 ③反应能量途径 Mopac/PM3计算的 CH3CH2OH H2O+CH2CH2反应的能量途径 括号内数据表示相对于反应物的能量（单位：kcal/mol） 10.3 溶剂化效应 10-3-1 计算下面典型SN2反应的机理和反应能量 F-+CH3Cl FCH3+Cl- 气相中的反应途径图 Mopac/PM3计算的 F-+CH3Cl FCH3+Cl-反应的能量途径 括号内数据表示相对于反应物的能量（单位：kcal/mol） 液相中的反应途径图 Mopac/PM3计算的 F-+CH3Cl FCH3+Cl-反应的能量途径 括号内数据表示相对于反应物的能量（单位：kcal/mol） 二、实验心得与体会 本章实验主要是对化学反应的模拟过程。化学反应是化学研究的核心，也是理论与计算化学的重点和难点。本章实验要求我们掌握分子热力学参数的计算方法、化学反应途径（微观机理）的计算方法以及了解化学动力学参数的计算方法。主要进行的实验内容有不同温度下