多位点序列分型.pptVIP

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  • 2019-11-03 发布于浙江
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多位点序列分型 Multilocus Sequencing Typing MLST Contents 两种分型方法的比较 MLST的步骤 MLST的方案设计 MLST的由来 实例分析 多位点酶电泳(Multilocus enzyme electrophoresis,MLEE) 根据酶的电泳迁移率的不同来描述变异 MLEE的缺点 不能推断特殊位点的碱基序列 不同实验室间的分型结果不能进行比较 MLST的首次使用 MLST是由多位点酶电泳(MLEE)衍生出来的 一种分型方法 在1998年,Maiden等首次将MLST应用于脑膜炎奈瑟菌分型 多位点序列分型 (MLST) 一种基于核酸序列测定的细菌分型方法 通过PCR扩增多个管家基因内部片段 测定其序列,分析菌株的变异 MLST的原理 MLST方法一般测定6~10个管家基因内部400~600bp的核苷酸序列,每个位点的序列根据其发现的时间顺序赋予一个等位基因编号,每一株菌的等位基因编号按照指定的顺序排列就是它的等位基因谱 ,也即是这株菌的序列型(sequence type,ST)。这样得到的每个ST均代表一组单独的核苷酸序列信息 。 序列型(ST) 序列型( Sequence-typying, STs )等同于MLEE得出的电泳型(Electrophoretic type, ET) 通过比较ST可以发现

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