甘蓝型油菜全基因组DELLA蛋白基因家族的鉴定.pdfVIP

中国油料作物学报 ２０１９，４１（３）：３６０－３６８ ＣｈｉｎｅｓｅＪｏｕｒｎａｌｏｆＯｉｌＣｒｏｐＳｃｉｅｎｃｅｓ ｄｏｉ：１０．７５０５／ｊ．ｉｓｓｎ．１００７－９０８４．２０１９．０３．００７ 甘蓝型油菜全基因组 ＤＥＬＬＡ蛋白 基因家族的鉴定和表达分析 贾永鹏，李开祥，昝领兄，姚艳梅，杜德志 （青海大学／青海省农林科学院／青海省春油菜遗传改良重点实验室／国家油菜改良中心青海分中心 ／农业部春油菜科学观测实验站／青海省春油菜研究开发中心，青海 西宁，８１００００） 　　摘要：ＤＥＬＬＡ蛋白是参与赤霉素调控途径的关键因子，对调节植物的生长发育具有重要的作用。为了揭示甘 蓝型油菜中ＤＥＬＬＡ蛋白家族的分布和特征，利用生物信息学分析了家族成员、序列特征、进化关系和组织表达。 结果表明，甘蓝型油菜中有１３个ＤＥＬＬＡ蛋白基因，被定位到８条染色体和２条随机序列（ｃｈｒＣ０９＿ｒａｎｄｏｍ和ｃｈｒＣｎｎ ＿ｒａｎｄｏｍ）上；系统进化树分析发现，该家族被聚为４个亚家族，第一亚家族含有７个基因，第二、三和四亚家族各包 括２个基 因；ＤＥＬＬＡ基 因呈组织特异性表达，其 中 ＢｎａＡ１０ｇ１７２４０Ｄ、ＢｎａＣ０９ｇ４０４２０Ｄ、ＢｎａＣｎｎｇ６８３００Ｄ和 ＢｎａＣ０５ｇ４７７６０Ｄ在各组织中表达都相对较高，在茎中ＢｎａＡ０６ｇ３４８１０Ｄ、ＢｎａＡ０９ｇ１８７００Ｄ和ＢｎａＣ０９ｇ５２２７０Ｄ表达最 高。本研究为后续基因的功能研究提供参考。 关键词：甘蓝型油菜；ＤＥＬＬＡ基因家族；基因表达 中图分类号：Ｑ７５，Ｓ５６５．４　　文献标识码：Ａ　　文章编号：１００７－９０８４（２０１９）０３－０３６０－０９ Ｇｅｎｏｍｅ－ｗｉｄｅｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎａｎｄｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎｏｆＤＥＬＬＡｐｒｏｔｅｉｎｆａｍｉｌｙｉｎＢｒａｓｓｉｃａｎａｐｕｓ  ＪＩＡＹｏｎｇ－ｐｅｎｇ，ＬＩＫａｉ－ｘｉａｎｇ，ＺＡＮＬｉｎｇ－ｘｉｏｎｇ，ＹＡＯＹａｎ－ｍｅｉ，ＤＵＤｅ－ｚｈｉ （ＱｉｎｇｈａｉＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，ＱｉｎｇｈａｉＡｃａｄｅｍｙｏｆＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒｅａｎｄＦｏｒｅｓｔｒｙＳｃｉｅｎｃｅｓ，ＫｅｙＬａｂｏｒａｔｏｒｙｏｆ ＳｐｒｉｎｇＲａｐｅＧｅｎｅｔｉｃＩｍｐｒｏｖｅｍｅｎｔＱｉｎｇｈａｉＰｒｏｖｉｎｃｅ，ＱｉｎｇｈａｉＳｕｂ－ｃｅｎｔｅｒｏｆＮａｔｉｏｎａｌＲａｐｅＩｍｐｒｏｖｅｍｅｎｔＣｅｎｔｅｒ， ＳｐｒｉｎｇＲａｐｅｓｅｅｄＳｃｉｅｎｔｉｆｉｃＯｂｓｅｒｖａｔｉｏｎＥｘｐｅｒｉｍｅｎｔａｌＳｔａｔｉｏｎｏｆｔｈｅＭｉｎｉｓｔｒｙｏｆＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒｅ， ＱｉｎｇｈａｉＰｒｏｖｉｎｃｅＳｐｒｉｎｇＲａｐｅｓｅｅｄＲｅｓｅａｒｃｈａｎｄＤｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔＣｅｎｔｅｒ，Ｘｉｎｉｎｇ８１００００，Ｃｈｉｎａ） Ａｂｓｔｒａｃｔ：ＤＥＬＬＡｐｒｏｔｅｉｎｉｓａｋｅｙｆａｃｔｏｒｉｎｖｏｌｖｅｄｉｎＧＡｒｅｇｕｌａｔｏｒｙｐａｔｈｗａｙｓａｎｄｐｌａｙｓａｎｉｍｐｏｒｔａｎｔｒｏｌｅｉｎ ｒｅｇｕｌａｔｉｎｇｐｌａｎｔｇｒｏｗｔｈａｎｄｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ．ＩｎｏｒｄｅｒｔｏｒｅｖｅａｌｔｈｅｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎａｎｄｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓｏｆＤＥＬＬＡｐｒｏｔｅｉｎ ｆａｍｉｌｙｉｎＢｒａｓｓｉｃａｎａｐｕｓ，ｆａｍｉｌｙｍｅｍｂｅｒｓ，ｓｅｑｕｅｎｃｅｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓ，ｅｖｏｌｕｔｉｏｎａｒｙｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐｓａｎｄｔｉｓｓｕｅｅｘｐｒｅｓ ｓｉｏｎｗｅｒｅａｎａｌｙｚｅｄｕｓｉｎｇｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ．Ｔｈｅｒｅｓｕｌｔｓｓｈｏｗｅｄｔｈａｔｔｈｅｒｅｗｅｒｅ１３ＤＥＬＬＡｐｒｏｔｅｉｎｇｅｎｅｓｉｎＢ．ｎａｐｕｓ， ｌｏｃａｔｅｄｏｎ８ｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅｓｗｉｔｈ２ｒａｎｄｏｍｓｅｑｕｅｎｃｅｓ（ｃｈｒＣ０９＿ｒａｎｄｏｍａｎｄｃｈｒ