《第五章_分子标记技术与植物育种》-公开课件.pptVIP

第五章 分子标记技术与植物育种 遗传标记－遗传基因－作物育种－农业生产 本章内容提要： 第一节 植物育种常用的遗传标记 第二节 分子标记的类型及原理 第三节 各标记间的联系和相互转化以及高通量分子标记和自动化分析 第四节 分子遗传图谱的构建和比较基因组作图 第五节 分子标记用于基因定位 第六节 分子标记辅助选择 第一节 植物育种常用的遗传标记 本节内容： 一、形态标记（morphological markers） 二、细胞学标记（ cytological markers ） 三、生化标记（ biochemical markers ） 四、分子标记（ molecular markers ） 概念：遗传标记（genetic marker）——定义为可以稳定遗传的，易于识别的特殊的遗传多态性表现型式。 在经典遗传学中，遗传多态性是指等位基因的变异（差异）；在现代遗传学中，遗传多态性是指基因组中任何座位上的相对差异。 遗传标记的特征: 1）可识别性：亲本间存在着多态性（即差异）。 2）可遗传性：亲本间存在的多态性在后代中可以重演。 遗传标记的类型: 形态标记，或可见标记（visible markers） 细胞学标记 （cytological markers） 生化标记（ biochemical markers） DNA标记（DNA markers） 遗传标记应具备的条件： ①多态性高； ②表现共显性，能够鉴别出纯合基因型和杂合基因型； ③对主要农艺性状影响小； ④经济方便，容易观察记载。 遗传标记的用途： （1）遗传研究：连锁分析、基因定位、遗传作图、基因转移和多样性分析等。 （2）植物育种：辅助选择。 在作物育种中，通常把与育种目标性状紧密连锁的遗传标记用于对目标性状进行追踪选择、辅助选择以及基因型鉴定。 遗传标记的发展： 形态标记：简单性状的遗传（普通遗传学）； 细胞学标记：染色体变异与细胞学特征（细胞遗传学）； 同工酶标记（蛋白质标记）：同工酶与电泳技术（生化遗传学）； 分子标记：DNA序列变异与检测技术（分子遗传学）： 一、形态标记 形态标记：指植物的外部形态特征，是一类容易观测，使用广泛的标记。典型的形态标记用肉眼可以识别和观察，也叫可见标记（visible markers），是指在个体上可以看见的遗传标记，如花色（红花、白花）、株高（高秆、矮秆），还有叶形、果色等性状通过观察即可作出判断。 广义的形态标记还包括那些借助简单测试即可识别的某些性状，如生理生殖特性、抗病虫性等。 如：水稻部分形态标记及标记基因 形态标记材料的获得方法：一般通过自然突变、物理或化学诱变来获得具有特定形态特征的遗传标记材料。 标记与基因的连锁分析方法：通过两点、三点测验来确定标记基因与目标性状之间的关系。利用已知位点的标记定位未知位点的新标记。 形态标记的实质：利用一个性状来推论另一个性状，或利用一个性状来推论它的遗传基因 形态标记的利用： 大麦中抗杆锈与抗散黑穗病基因连锁，选一个可连带另一个基因。 棉花芽黄与核雄性不育基因共分离，苗期可以鉴别可育株和不育株用于制种。 形态标记曾经发挥过很大作用，但其标记的数量少、周期长、多态性差、易受环境影响。因此，在育种中应用是非常有限的。 二、细胞学标记 细胞学标记：即能明确显示遗传多态性的细胞学特征。 研究表明：染色体的数目和结构的变化，包括单、缺、三、四体；缺失、易位、倒位、重复；核型（染色体数、大小、随体有无、着丝粒位置等）和带型（C带、N带、G带等）都会引起某些表型性状的变异。因此，可作为一种遗传标记加以利用。 染色体结构和数量的直接分析方法：染色体核型分析和染色体带型分析。 染色体核型：染色体数目、大小、随体有无、着丝粒位置等 核型特征指染色体的长度、着丝粒位置和随体有无 染色体的数量特征：细胞中染色体数目的多少 染色体数量上的遗传多样性 整倍性变异：单倍体、多倍体 非整倍性变异：缺体、单体、三体、端着丝点染色体等 用具有染色体数目和结构变异的材料与染色体正常的材料杂交，其后代常导致特定染色体上的基因在减数分裂过程中的分离和重组发生偏离，由此可以测定基因所在的染色体及其相对位置。 因此染色体数目和结构的特征可以作为一种遗传标记。 染色体数目和结构变异常具有相应的形态学特征，因此可以提高这些标记的鉴定和利用效率。 又如： 小麦和黑麦杂交创造的1RS/1BL易位系，在1RS上携带有抗锈病和抗白粉病等基因。根据1RS/1BL染色体在小麦背景中不呈现次缢痕，看不到随体，1RS特有的C带带型等细胞学证据，可以判断后代是否携带有所需要的来自黑麦的抗性基因。 染色体带型：C带、N带、G带等 带型特征指染色体经特殊染色显带后，带的颜色深浅、宽窄和位置顺序等，可以反映出常染色质和异染色