细胞内tradeoff和基因表达、生长的关系.PDFVIP

细胞内trade—off 和 基因表达、生长的关系 姜凌瀚 2015.12.3 背景 1.细胞过程相互联系, 但经常假设其独立 2.经常碰到的现实问题: 微生物的生长速率影响基因组范围内的基因表达 对转录因子的特殊控制经常被全局的非特异调控所掩盖, 这些调 控反应了细胞的生理状态 合成生物学中, 合成回路和宿主不兼容 3.虽有研究说明细胞过程间的联系, 但只是定性说明. 本文所做的事情 1.提出描述trade-off的最简模型（粗粒化） 2.着重关注三种trade-off : i.有限细胞能量, 不同生化过程 ii.有限核糖体, 不同mRNA翻译过程的trade-off iii.有限蛋白质组, 表达一种蛋白减少其他类型的蛋白 3.模型能预测蛋白质组的分配, 能量交易（Energy turn-over ） 生理现象（生长速率）, 联系细胞行为和分子机制 4.模型解