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- 2020-02-19 发布于湖北
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一些注意事项 连接编辑器 使用鼠标也可对原子进行重排,其操作以参考原子为基础进行: ①左键点击。指定点击原子为参考原子。 ②右键点击。点击原子与参考原子交换原子标签,该原子成为新的参考原子。 冗余坐标编辑器 用于创建和编辑冗余坐标,冗余坐标常用于Gaussian 优化或势能面扫描中。 分子轨道编辑器 注意需从检查点文件中读入文件。 精品课件 * 计算工具栏【Calculate】 ◆创建 Gaussian 作业 【Calculate】→【Gaussian Calculation Setup】 精品课件 * 【Job Type】选项卡 精品课件 * 【Method】选项卡 精品课件 * 【Title】选项卡 精品课件 * GaussView 的窗口组成 精品课件 * 独立工具条视图 -----分子工具栏 -----计算工具栏 -----文件工具栏 -----坐标工具栏 -----视窗工具栏 ----文件窗口工具栏 构建工具面板 精品课件 * GaussView 的窗口组成 主控窗口 含有菜单条和当前选择的分子碎片。 各类工具 默认时,位于主控窗口的菜单条下面。这些工具可以被 分开, 也可按要求重新排列在主控窗口内。 各类对话窗口 对应于 GaussView 的不同用途。 一个或多个分子模型视窗 控制程序功能的各类预置参数 点击【File】→【Preferences】 精品课件 * GaussView鼠标键盘操作 ﹡鼠标的操作 在窗口内任意位置点击鼠标左键并按住,此时移动鼠标,窗口内所有分子跟随转动。 在窗口内任意位置点击鼠标右键并按住 上下移动鼠标:分子会放大缩小 左右移动鼠标:分子沿垂直屏幕的轴转动。 在窗口内任意位置点击鼠标中键(或者滚轮)并按住,此时移动鼠标,屏幕内的所有分子将跟随平移。 使用滚轮前后滚动,当前窗口内分子放大缩小。 精品课件 * 键盘与鼠标配合 当窗口中有多个分子, 只想转动或者移动其中一个分子, 按住键盘【Alt】键 用鼠标左键点击某个分子并按住,此时移动鼠标,只有被点击的分子会转动; 用鼠标中键(或滚轮)点击某个分子并按住,移动鼠标,只有被点击的分子会跟随鼠标移动 用鼠标右键分子点击某个分子并按住,左右移动鼠标,只有被点击的分子会沿一个垂直屏幕的轴转动; 如果鼠标没有中键/滚轮,或者使用中失效的处理: 按住【Alt】+【Shift】键,用鼠标左键点击你要转动的分子并按住,只有被点击的分子会跟随鼠标移动 精品课件 * 练习1 使用刚才讲述的键盘鼠标操作知识将三个苯环摆到相互重叠的位置 GV_exercise_1.gjf GV_exercise_1_OK.gjf 精品课件 * 调出独立的Builder面板 点击【View】菜单中的【Builder】即可调出独立的Builder面板,该面板是一个前置的面板,即始终显示在其它面板/窗口的上方,有利于全屏幕搭建分子时使用。 精品课件 * 构建工具面板【Builder】 元素工具 精品课件 * 工具栏“图钉” “图钉”未按下 选择了需要的元素片断之后窗口会关闭。 “图钉”已按下 选择了需要的元素片断之后窗口不关闭。 精品课件 * 环工具 1 精品课件 * 常见分子片断和生物分子残基 常见分子片断和生物分子残基 精品课件 * 自定义分子片断 精品课件 * 键长、键角、二面角 精品课件 * 图形显示中的化学键 优化完了,用GaussView打开,发现键断了或者键级变了怎么办? 这是很正常的现象,图形界面中为了清晰显示,使用各种球棒模型来表示原子和化学键,用棒的多少表示键级,但真实的体系中只存在很小的原子核和它们周围相互重叠的电子云。 GaussView的显示也只是经验性的,不能因为GaussView显示了化学键就认为原子间成键,没有显示就认为没有成键。 建模时,你可以给离得很远的两个原子之
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