大规模基因组测序中信息分析.pptVIP

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2020-03-08 发布于福建
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大规模基因组测序中信息分析.ppt

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大规模基因组测序中的信息分析--拼接与注释大规模测序是基因组研究的最基本任务，它的每一个环节都与信息分析紧密相关。从测序仪的光密度采样与分析、碱基读出、载体标识与去除、拼接与组装、填补序列间隙、到重复序列标识、读框预测和基因标注的每一步都是紧密依赖基因组信息学的软件和数据库的。 ;;Sequence Data Distribution; How to find the coding regions in rude DNA sequence?;;Neural Network Procedure;If neuron j is in the output layer (i.e.,l=L), set ;-------------??;;Fractal Dimension of Exon and Intron Sequences;0 0.5 1 1.5 2 2.5 3 3.5 ;Complexity analysis;Relative Complexity in Exon, Intron and Flanks ;Using the methods and techniques in cryptology ;Coincident index;COINCIDENT INDEX OF EXON AND INTRON;The Values of Coincident Index in HSHSC70 Sequence;ORF Prediction of the Contig by 5 Method;Composite Artificial Neural Network System;Auto-annotation Procedure;;A. T. tengcongensis Complete Genome Analysis;大规模全基因组shotgun测序 Shotgun 反应: 109,970 有效总读长：26,553,803bp 基因组总长：2,689,445bp 冗余度：9.87× PCR补洞 PCR反应：40,000 PCR产物测序：4,100;Circular representation of the genome of T. tengcongensis MB4; 谢谢各位!;