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动力蛋白的结构与功能 姜灜博 2014301060008 摘要：:在一系列的生物化学反应中，包括纤毛的摆动，细胞分裂以及细胞内的物质运输，动力马 达蛋白参与其中，在ATP 水解供能下，产生力的作用并在微管蛋白上运动。由于动力蛋白的大分 子量和高复杂程度，阐释它的作用机理是一项艰巨的任务。然而，通过一系列的途径，包括X 射 线晶体学，冷冻电镜，单分子检验，以及生物化学实验等技术，在理解这些巨大的动力蛋白作用 机制方面，我们已经取得了重大的进步。通过这些研究，我们提出了一个动力蛋白运动的机械化 学循环(mechanochemical cycle)模型，在这个模型中，ATP 驱动动力蛋白中AAA+环的弯曲运动， 改变了其微管蛋白结合体(microtube-binding stalk)的亲和性，并且使它的机械元素变构，积累 能量。 关键词 dynein motor protein mechanochemical cycle AAA+superfamily 1 动力蛋白的起源 动力蛋白(dynein)是三种细胞骨架马达蛋白中的一种。50 年前，它最初被认为是一种ATP 酶，并 被Gibbons 和Rowe 以一种力的单位dyne 命名。随后，细胞液形式的动力蛋白从脑组织中分离， 并显示出驱动向细胞内微管蛋白负极方向运输的功能。动力蛋白的发现正好与驱动蛋白的发现相 补充，这种蛋白能向微管蛋白的正极方向移动。 我们知道动力蛋白和驱动蛋白(kinesins)都是沿着微管进行移动的，于是我们推测，相比于在肌 动蛋白上运动的肌球蛋白，这两种蛋白质的运动机理有着更多的相似性。然而令人惊讶的是，肌 球蛋白和驱动蛋白的结构显示，尽管他们在不同的细胞骨架分子上运动，他们都具有G protein r i elated fold 结构，并且在核心机理上具有一致性。 动力蛋白属于AAA+总科。和常规的AAA+ATP 酶相似，动力蛋白含有一个由六个AAA+模块组成的环 状核心，但不同的是，这六个模块是由一条多肽链形成的，同时还有几个独特的附属物(appendag e)连接以确保功能。在过去的两年间，动力蛋白的马达结构域的晶体结构被解析出来，并且单分 子实验，活细胞成像，以及电子显微镜成像为我们洞察马达蛋白的动力学特征提供了帮助。 2 动力蛋白的分子结构 如图所示，a 是动力蛋白重链的线性表示。一个动力蛋白分子包含以下部分：N 端尾部结构域(tai l domain)、接头结构域(linker domain)、马达结构域(motor domain)、6 个AAA+模块、螺旋缠 绕的柄状结构(coiled-coil stalk)、尾部(stalk)以及C 端区域。c 图描绘了动力蛋白马达结构域 的结构。马达结构域的N 端部分形成细长的接头结构域，它在催化区域上部形成拱形，能够传递 收缩力。动力蛋白的催化中心包含6 个AAA+模块，和同总科形成寡聚体的AAA+六聚物不同，这6 个AAA+动力蛋白模块处在同一条多肽链上，并被短的连接序列连接，它们各自具备不同的性质。 例如，只有前4 个模块具有ATP 结合的功能基元。在接头的另一面，C 端的结构域AAA5 和AAA6 相 互作用，对环状结构起修饰作用。微管结合结构域位于从AAA4 伸出的一对反向平行缠绕的α螺旋 杆状结构的顶端。在它的基部，杆状结构和从AAA5 中伸出的第二个螺旋尾部相互作用。这样的高 度伸展的结构，使得ATP 的分解和微管蛋白的结合位点相聚25nm 的距离，能够产生大范围的结构 变化。 3 机械化学循环(mechanochemical cycle) 动力蛋白功能的核心在于马达结构域的运动。此羧基末端的重链区域可以重组表达为稳定的单体 实体，并包含使ATP 水解转化为运动的所有部件。研究表明，这个过程是包含一个机械周期，其 中化学转换(ATP结合，ATP 水解和无机磷酸Pi 和ADP 的释放)和马达结构域的结构变化相关联。 相反，结构的变化(如微管结合)反过来可以影响化学转换的速率。虽然某些数据，例如在动力蛋 白家族内循环周期各不相 同，这可能反应了他们对于