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Histone ubquitinationdeubquitination
The structure of nucleosome
组蛋白是一种11-15KDa的碱性蛋白,与DNA相互作用构成核小体。
核心组蛋白的尾巴伸出来,受到广泛的修饰。
Ubquitin
泛素(ubiquitin,Ub)是高度保守的、含76个氨基酸的蛋白质,分子量为8.5 kDa,在真核生物体内广泛存在。
泛素分子氨基端1-72位点的氨基酸残基形成一个紧密球状结构,紧靠羧基端的4个氨基酸残基是随机盘绕的(random-coiled)。
UbiquitinationDeubiquitination
泛素化修饰就是底物的赖氨酸残基位点与泛素分子的羧基末端相互结合的过程。
由于泛素本身的7个赖氨酸位点, 也可与另一个泛素相结合, 因此单泛素化的底物蛋白, 可作为Seed,结合多个泛素,形成了多泛素化修饰。
GENES DEVELOPMENT 17:2733–2740 . 2003 by Cold Spring Harbor Laboratory Press
Histone Ubiquitination
Histone ubiquitination
Primary monoubiquitination
reversible,regulated by ubiquitinase and deubquitinase
Histone modifications crosstalk
Involved in multiple cellular events---gene expression regulation、DNA damage response and repair、female X chromosome inactive and so on
除了单泛素化,H2A/H2AX在DNA损伤时可发生K63位的多泛素化
负责H2A/H2B泛素化与去泛素化的酶
H2A-specific Common to H2A/H2B H2B-specific
Histone ubiquitinase
One E1(activating),
mutiple E2(conjugating),
substrate-specific E3(ligase)
Schematic depiction of histone ubiquitination
Methods. 2011 Jul; 54(3): 315–325.
E3主要有两大类:
HECT(homologous to the E6-AP carboxyl terminus) 结构域家族,通过与泛素形成催化作用所必需的硫酯键发挥作用
RING(really interesting new gene)结构域家族,为E2和底物提供居留位点从而使 E2 催化泛素转移到底物上
Histone deubiquitinating enzyme(DUBs)
H2A deubiquitination
USP 16: HOX gene silencing, DNA damage repair
X chromosome inactivation, cell cycle progression
2A-DUB :interacts with PCAF
USP21: regulator of liver regeneration
BAP1: C-terminal hydrolase,repression of HOX genes
H2B deubiquitination
Ubp8 :reside within SAGA,Transcription
Ubp10 (Dot4):Sir-mediated telomeric and rDNA silencing
Function of Histone Ubiquitination
Transcription regulation
DNA damage response
inactive X chromosome:H2Aub
chromatin boundary integrity:H2Bub
stem cell maintenance and differentiation
Histone Ubiquitination and Deubiquitination in Transcription,
DNA Damage Response, and Cancer. Front Oncol, 2(26),Cao J Yan Q,2012
Regulation of cell cycle progression —chro
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