培训课件Gaussian软件的使用率分析维里定理计算模型化学模型.ppt

检查优化输出文件 ? 在得到最优构型之后，在文件中寻 找 --Stationmay point found 。 ? 其下面的表格中列出的就是最后的 优化结果以及分子坐标。 3.3 寻找过渡态 ? Gaissian 使用 STQN 方法确定反应 过渡态，关键词是 Opt=QST2 ? QST3 方法，可以优化反应物，产 物和一个由用户定义猜测的过渡态 。 Gaussian 软件的使用 华南农业大学理学院 王炳锋 Gaussian98/03 的功能 ? 分子的能量和结构 ? 过渡态的能量和结构 ? 振动频率 ? 红外和拉曼光谱（包括 预共振拉曼） ? 热化学性质 ? 成键和化学反应能量 ? 化学反应路径 ? 分子轨道 ? 原子电荷 ? 电多极矩 ? NMR 屏蔽和磁化系数 ? 自旋 - 自旋耦合常数 ? 振动圆二色性强度 ? 电子圆二色性强度 ? g 张量和超精细光谱的 其它张量 ? 旋光性 ? 振动 - 转动耦合 ? 非谐性的振动分析和振 动 - 转动耦合 ? 电子亲和能和电离势 ? 极化和超极化率（静态 的和含频的） ? 各向异性超精细耦合常 数 ? 静电势和电子密度 Gaussian 的文件 ? Gjf 计算任务文 件 ? Chk 临时文件 ? Rwf 读写文件 ? Int 双电子积分 ? D2e 双电子积分 导数文件 ? PDB ， ENT ? MOL ， HIN ? CDX ， C3D 运行界面 准备知识 ? Schrodinger 方程 ? Born-Oppenheimer 近似 ? Hellmann-Feyman 定理 ? 维里定理 计算模型 ? 分子力学（ Molecular Mechanics ） ? MM+ ， AMBER ， UFF ， ComFa 等 ? 电子结构模型（ Electronic Structure Theory ） ? 半经验方法 ? 从头算 ? 密度泛函 化学模型 ? 计算方法（ method ） Gaussian 关键词 方法 HF Hartree-Fock 自恰场模型 B3LYP Becke 型 3 参数密度泛函 型，采用 Lee-Yang-Parr 泛函 MP2 二级 Moller-Plesset 微扰理论 MP4 四级 Moller-Plesset 微扰理论 QCISD(T) 二次 CI ? 基组（ basis set ） ? 开壳层，闭壳层 Rational Theoretical Model ? semiempirical ? HF ? MPn ( Moller-Plesset ) n=2~5 ? Coupled CLuster ? Quadratic ConfigurationInteraction ? Density Functional Theory Methods ， DFT 资源的使用 基组的影响 ? 基组是体系内轨道的数学描述。大 的基组由于对电子在空间上有小的 限制而具有更大的精确性。 ? 用于电子结构计算的标准的基组使 用线性的高斯函数来模拟轨道。 最小基组 ? 最小基组包含了描述轨道的最少的 函数数量。 H ： 1s C ： 1s ， 2s ， 2px ， 2py ， 2pz ? STO-3G 是最小基组 分裂基组 ? 增大基组的第一个方法就是增加每个原子基 函数的数量。分裂基组，比如 3-21G 和 6- 31G ，对于价键轨道都用两个函数来进行描 述，比如 H ： 1s ， 1s C ： 1s ， 2s ， 2s ， 2px ， 2py ， 2pz ， 2px ， 2py ， 2pz‘ 双 zeta 基组，如 Dunning-Huzinaga 基组 (D95) ，采用每个原子的两种不同大小的函数的线 性组合来描述分子轨道。同样的，三重分裂 基组，如 6-311G ，采用三个不同大小的收缩 函数来描述轨道。 极化基组 ? 分裂基组允许轨道改变其大小，但 不能改变形状。极化基组则取消了 这样的限制，增加