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- 2020-07-22 发布于四川
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16srDNA信息分析
1.标准信息分析(初级)
1.1 基本数据处理(使用内部撰写的程序对原始的测序数据进行基本处理)
通过Illumina平台(Miseq)进行Paired-end测序,下机数据经过去除低质量reads(Q20, 90%标准过滤),并trim掉reads2 尾部100bp 低质量序列;每个样品数据产出详细统计结果见下表:
表1-1 reads数据统计:
# Samples
# HQ reads (total)
# HQ reads (mean±SD)
CA
17
110,651
6,509±2,175
HC
19
163,690
8,615±3,0
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