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目的
实验室所有的工作其目的都是为了得到准确的检验报告,检验报告书实验室与临床医务人员、患者沟通的桥梁,也直接影响临床对于患者所采取的医学干预措施。
为确保检验报告的准确及能够被正确解读,特编制此文件对分子诊断与遗传组所有检验报告的编制、审核、发送、修改及异常结果进行规范。
定义及适用范围
分子诊断与遗传组所有检验报告的编制、审核、发送、修改除了应该遵循TJCL-PF027《检验结果的评审程序》、TJCL-PF028《结果报告程序》、TJCL-PF029《机密信息管理程序》的要求外,还应遵循此文件的要求。
职责
实验室技术人员按照各检测项目SOP的要求进行常规检验报告的编制、审核及发送。对于有疑问的报告或异常结果应上报给实验台主管,在问题依然没有得到处理或有疑问或意见不能达成一致时需上报给组长或小组负责人。
原始数据的审核
在检验报告的编制及录入以前,从事实验操作的技术人员应对检测的原始数据进行审核,在确保室内质控制控的情况下审核的内容包括但不限于以下方面:
基于核酸杂交技术的检测项目,样本应具有足够的信号强度,若设置有内对照,其内对照的结果应符合预期。
基于Real-Time PCR原理的检测项目,若每个样本均含有内对照,则在报告发送时必须审核每个样本的内对照是否符合厂家说明书的要求。
基于Real-Time PCR原理的定量检测项目,标准曲线R20.95或error值0.4。
基于一代测序技术的检测项目,推荐对有阳性发现的样本进行反向测序进行验证,而对于遗传性疾病或肿瘤性疾病诊断的阳性发现位点,必须进行反向测序确认。在对每批次样本的测序数据进行分析时,BC Status状态应显示为通过并且每个样本的Score值应30,否则应重新进行测序。
基于基因芯片的检测项目,适用时应审核每个样本的平均信号强度及探针的正确识别率是否符合厂家建议,如Illumina Iscan检测平台的样本其P95red值应20000,探针正确识别率应95%。
适用时应注意审核当前批次所有患者结果的阳性率与以往阳性率是否存在差异,若阳性率差距明显且无法解释原因,该批次样本应重新检测。
对于原始数据审核不通过的样本,等同于质控失控进行处理。
检验报告的编制
一份完整的检验报告至少包括患者信息、样本信息及检测结果这三部分内容。分子诊断与遗传由于其所具有的专业特性,检验报告的内容和格式在满足TJCL-PF028《结果报告程序》的前提下还应符合以下要求:
5.1检验结果的录入
对于需手工录入检测结果的报告(包括手工录入结果经LIS发送的报告和所有不经LIS发出的报告),必须由经过授权的双人审核。对于由仪器自动传输结果的报告,此条款不适用。
5.2检验结果的书写
检验结果的书写应遵循标准术语和行业规范。染色体核型的书写应遵循ISCN的规范,如:arr[Hg19]4q21、21q21.23(81,852,970-85,250,734)x1 此结果代表该样本是采用微阵列基因芯片的方法进行检测,所采用的数据库是Hg19,在4号染色体长臂2区1带2亚带1亚亚带至2区1带2亚带3亚亚带检测到了一个基因组片段仅具有一个拷贝,该片段起始位点为81,852,970,终止位点为85,250,734.
DNA测序结果的书写应遵循HGVS的规范,如:c.563AG,p.Gln188Arg此结果代表某一基因的cDNA第563位碱基由A变成G,由于该突变导致其第188位的氨基酸由Gln(谷氨酰胺)变成Arg(精氨酸)。
5.3检验内容的说明
大部分情况下,检测项目能够反映实验室的检测内容。而对于基于测序技术的检测项目,在最终报告中必须对该样本本次实验的检测内容进行声明,如某一基因或某几个基因、某一基因的某几个内含子或某几个外显子。
5.4检验结果的解释和讨论
对于遗传性疾病或肿瘤性疾病及个体化医疗的检测项目,对于检验结果的解释是必须的。结果的解释内容包括但不限于以下几个内容:杂合性、碱基改变、氨基酸改变、与临床表型或临床医学干预措施之间的相关性、所引用的医学数据库(应注意数据库的更新)等。
对于孟德尔遗传病基因测序报告的解读,CAP和ACMG在2015年3月颁布了行业指南,将检测到的基因突变分为致病、可能致病、良性、可能良性、意义未明五种类型,实验室在进行结果解释时可参考该指南的要求。
由于基因组的功能研究还有太多未解之谜,部分时候对于遗传性疾病报告或肿瘤性疾病检测报告的解读是非常困难的事情,适当的时候需对结果解释进行讨论,讨论的内容可能包括对该技术和检测内容对于某种疾病诊断的敏感性、阳性结果可能带来的临床结局、疾病的外显率、复发风险等。
5.5检测局限性的说明
受制于所采用的分子生物学技术,分子诊断的许多检测均匀其固有的局限性,如一代和二代测序对于长片段的缺失和重复不敏感,有时候即使是一
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