寡营养细菌文献综述 .docVIP

海洋中寡营养细菌的分离培养技术及环境适应机制研究进展 摘 要 生存于北极海洋的细菌归属于极端微生物,它们是目前发现最古老的生物类群。来自北极的细菌具有极强的环境适应能力,能够在北极地区独特气候形成的强酸碱、干燥、强辐射、高盐、高压、寒冷、寡营养等极端环境下生存繁衍。独特的生存环境造就了北极细菌独特的代谢水平上的适应机制和分子水平上的代谢机制,这些独特的生物在北极地区生态系统循环中发挥着不可或缺的作用。与此同时,它们还蕴藏着生命的起源、遗传、进化和巨大的工业用途等多方面的奥秘。然而,对于人类研究而言,如此庞大的极端微生物资源库中,绝大多数还是未知菌。Ekeiof于1908年首次报道了他分离自南极的微生物,从此以后,极地作为潜在微生物资源库,逐渐引起人类的广泛关注,成为了研究热点。对北极微生物多样性的研究,将会为人类发掘利用北极地区微生物的物种资源和基因资源提供理论依据。对极地细菌的分离鉴定,将会为人类带来产生生物活性物质的新菌株,而这些生物活性物质很可能是新型药物、生物保健品的源泉,具有重要的工业应用价值。 关键字：海洋寡细菌；培养方法；研究进展；研究前景 1、前言： 早在1959 年, 人们就认识到在琼脂平板上可培养的微生物和通过显微计数测得的微生物相差好几个数量级。1987 年Carl Woese 通过生物核糖体RNA的序列分析提出了生物体三域的学说, 自此, 16SrRNA 的系统分类学研究日见广泛地应用于环境微生物分析。这种基于DNA/RNA 测序技术与序列分析的方法不依赖于传统的微生物培养技术, 极大的拓宽了人们对地球上微生物多样性的认识。至今为止, 在人类已知的原核生物53 个门的分类单元中 只有26 个门囊括了经过实验室培养的细菌[1,2]。在可培养微生物的 16S rRNA 基因库中, 紫色光合菌(Proteobacteria) 等细菌(包括Cytophagales 和两类革兰氏阳性菌:Actinobacteria 和低G+C 含量菌)占所有已知细菌的90%[3]。此外至少有一半的微生物只是以RNA 序列的代号存在于环境基因序列库中[2] 对它们的分类命名还需要培养方法上的进一步改进而加以确认。当前, 微生物培养仍然是海洋微生物学和微生物生态学研究中的重要一环。海洋环境中优势异养浮游菌获得培养后, 研究者可对影响其个体生长的营养条件和其他环境变量进行研究, 从而确该优势种在地球化学循环中所起的生态学作用。此外,人们普遍认为生长缓慢的海洋细菌是潜在的药源生物, 产生许多具有独特药用价值的新颖天然产物[4,5], 这些微生物的进一步培养是未来新药发现的重要前提。海洋环境中, 细菌是跨界面物质输送的主要化能异养生物, 它们在Nanomolar 水平调节水体可溶性生物来源的有机质, 有助于补充和丰富食物网,但这方面相关单种的生理生态作用研究还很少, 许多环境中的优势种都不可培养[6], 大量的、多样化的浮游寡营养细菌很少被人们所关注, 因为如何有效而方便的进行实验室培养仍然是一道鸿沟, 其特殊的营养需求-寡营养条件, 仍然值得我们投入相当多的研究力量。 2、研究方法 通常情况下, 海洋是典型的寡营养环境, 溶解性有机碳(DOC)水平常年维持在50 μmol/L~100 μmol/L或0.6 mg/L~1.2 mg/L。偶然情况下, 局部营养可能出现大的波动。过去认为这种碳源极低的环境普遍不适合微生物的生长, 偶然出现的局部营养富集,才是海洋微生物多样性的原始策动力。然而, 近几年的研究表明, 海洋微环境的多样化使细菌具有了明显不同的生长特征[7], 从而形成了极富特征的海洋微生物多样性, 按不同的生存策略, 这些微生物可分为富营养菌和寡营养菌(Oligobacteria)。富营养菌代表了生态学里的机会种, 为了充分利用海洋中偶然和局部出现的富营养环境, 这些微生物可以快速移动, 高速生长[8], 其生长和死亡速率变化较大, 细菌丰度波动较大[9]。与富营养菌相反, 在寡营养海水中生活的细菌需要一个更节约能量的生存策略, 它们自由生活在极低水平碳环境中, 个体微小, 生长缓慢, 生长速率和丰度变化很小[10], 以达到最大的营养利用率。这些微小的寡营养细菌有一个高效的营养吸收机制,在低营养浓度下, 它们依然可以吸收足够的有机质来维持生长, 营养的增加甚至会阻碍其生长[11]。kuznetsov 等将寡营养微生物定义为可在有机碳含量1 mg/L~15 mg/L 的培养基上生长的微生物[12];Ishida 等认为生长在低于1 mg/L 的有机碳水平的细菌才属于寡营养类型[13]; Fry 则将其描述为不能在大于6 mg/L 的有机碳浓度中生长的微生物[14]。但寡营养状态是一种适应于超低营养条件下的生活史而非一个固定的生理