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计算机辅助药物设计
◆计算机辅助药物设计的概念
◆药物设计的理论基础
◆结合自由能的计算
◆基于受体的药物设计
计算机辅助药物设计的概念
计算机辅助药物设计方法( computer-aided drug design,CADD)是药物
分子设计的基础,是新药研究的工具,它是依据生物化学、酶学、分子生物学
以及遗传学等生命科学的研究成果,针对这些基础研究中所揭示的包括酶、受
体、离子通道及核酸等潜在的药物设计靶点,并参考其他内源性配体或天然产
物的化学结构特征,设计出合理的药物分子。
计算机辅助药物设计方法分类
1]基于受体结构的药物分子设计方法( receptor-based drug design),也称为直接
性药物设计方法。其前提条件是受体的三维结构为己知,或者可以通过同源建
模( (homology modeling的方法得到。常用的方法是分子对接虛拟筛选和重新配
体设计。
(2)基于配体小分子的药物分子设计方法(gand- based drug design,也称为间
接性药物设计方法。这类方法经常应用于缺乏受体结构的情况。这一方法主要
包括定量构效关系方法和药效团模型方法。
基于受体配体结构的药物设计流程图
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维数一体性
现有化自物
构象优化香
活性测定
化合物
化学合成
基于受体结构的药物设计
基于配体结构的药物设计
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