生物信息学在肿瘤研研究中应用.pptVIP

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生物信息学在肿瘤研究中 的应用 肿瘤生物信息学平台功能简介 及应用实例 张新宇 中国医科院肿瘤医院/肿瘤研究所 中心实验室 生物信息学 生物信息学的概念 A.生物信息学是一门新兴的交叉学科 它将数学和计算机知识应用于生物学 以获取、加工、存储、分类、检索与分 析生物大分子的信息,从而理解这些信 息的生物学意义 B.简言之,生物信息学就是运用计算 机技术,处理、分析生物学数据,以揭 示生物学数据背后蕴藏的意义。 生物信息学研究的要素 计算机(服务器/工作站)及操作系统 2.专业人员 3.专业软件 4. Internet网络及生物学数据库 生物信息学研究分类 算法开发 生物学研究应用 blas 生物信息学和肿瘤硏究的关系 How is tumor generated 4 晶密三▲ 皇凸皇▲ 1996,97国际 ▲皇B 象棋人机大战 四公 222 A盘A 24 密旦 公 2被誉为“人类智力极 限”的特级大师,卡 斯帕罗夫ⅤSIBM深 及AA 丛AAAA What Can Bioinformatics Do in Cancer Research? How to do? 肿瘤生物信息学平台简介 数据库平台 自主开发的综合分析体系 自主开发的其他独立功能软件 其他引进并安装调试好的软件包 平台的产生及发展 数据库平台:(基于 Linux系统的 My SQL数 据库系统) 1)Reference, Locus Link, Unigene Mapview及相关 GenBank数据库。 2) Gene Ontology数据库,从细胞定位, 基因功能,信号通路三个角度提供对 各种基因的功能及所在信号通路的注 释 数据库平台(续) 3) UCSC Human Genome数据库 ( Golden path)。 格式化的 Blast数据库(nt,nr, human est, htg, swissprot yeast, mouse est…)。 )实验室原始数据及分析结果数据库 (加密保护)

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