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ICS 65.020.20
B 16
DB37
山 东 省 地 方 标 准
DB37/T 4101—2020
苹果轮纹病菌快速检测方法
Rapid detection of botryosphaeria dothidea
2020 - 08 - 31 发布 2020 - 10 - 01 实施
山东省市场监督管理局 发 布
DB37/T 4101—2020
除有特殊说明外,所有实验用试剂均为分析纯;实验用水为GB/T 6682中规定的一级水。
1)
5.1 等温扩增PCR 混合液(2×Lamp PCR Master Mix ):包含40 mmol/L Tris-HCl、20 mmol/L (NH ) SO 、
4 2 4
20 mmol/L KC1 (pH 值为8.8)、16mmol/L MgSO 、2.0 mmol/L dNTPs、0.2 % Trion X-100。
4
5.2 Bst DNA 聚合酶:酶浓度8 U/ μL。
5.3 显色液:SYBR Green I 荧光染料,1 000×。
5.4 引物:根据苹果轮纹病菌ITS 基因序列设计一套特异性引物,包括外引物1 (F3),外引物2 (B3),
内引物1 (FIP),内引物2 (BIP),环引物1 (LF)和环引物2 (LB)。外引物扩增片段长度:189bp,
引物序列见附录A。
2)
5.5 DNA 快速提取液:DNA-EZ Reagents All-DNA-Fast-Out 。
5.6 甜菜碱:5 mol/L。
5.7 离心管:0.1 mL、1.5mL。
5.8 塑料研磨棒:长度70 mm,研磨头外径6.2 mm,研磨头长度9.5 mm。
6 仪器设备
6.1 恒温箱:满足65 ℃±3 ℃、80 ℃±1 ℃要求。
6.2 移液器:量程0.5 μL~10 μL,量程10 μL~100 μL,量程100 μL~1 000 μL。
7 测定步骤
7.1 试验设置
7.1.1 阴性对照:采用不含有目标基因序列的苹果腐烂病菌(Valsa mali)基因组DNA 为模板。
7.1.2 阳性对照:采用含有目标基因序列的苹果轮纹病菌(Botryosphaeria dothidea )基因组DNA
为模板,浓度应略高于方法检出限。
7.1.3 空白对照:以水代替DNA 模板。
7.2 试样采集
进行田间轮纹病菌快速检测时,切取约0.5 cm×0.5 cm待检测的苹果组织(果实、叶片、枝条),
放置于1.5 mL离心管中保存并标记。
7.3 试样DNA 提取
7.3.1 将100 μL DNA 快速提取液加入到盛有试样的1.5mL 离心管中,用研磨棒研磨5 min。
7.3.2 80 ℃±1 ℃加热5 min,如果是难以破裂的细胞和材料,则保温时间可以延长到10min~30 min。
7.3.3 用手振荡混匀后取裂解物直接进行LAMP 反应。
7.4 LAMP 反应步骤
7.4.1 反应体系
1) 由生工生物工程(上海)股份有限公司提供,给出这一信息是为了方便本标准的使用者,并不表示对该产品的
认可。如果其他等效产品具有相同的效果,则可使用这些等效产品。
2) 由生工生物工程(上海)股份有限公司提供,给出这一信息是为了方便本标准的使用者,并
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