硬叶兜兰居群水平的ITS基因扩增与信息分析.docxVIP

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  • 2020-10-04 发布于江苏
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硬叶兜兰居群水平的ITS基因扩增与信息分析.docx

经典专科、本科、硕博、研究生、期刊毕业论文 仅供参考 精心整理 仅供参考 勿用作商业用途 西南林业大学 本科毕业(设计)论文 (2018届) 题目:硬叶兜兰居群水平的ITS基因扩增与信息分析 教学院系 园林学院 专 业 园艺14 学生姓名 张如礼 指导教师 李宗艳(副教授) 评 阅 人 2018年4月3日 硬叶兜兰居群水平的ITS基因扩增与信息分析 张如礼 (西南林业大学园林学院,昆明650224) 摘要 为优化兜兰ITS-PCR反应体系,以硬叶兜兰为试材,用改良的2×CTAB提取总的DNA,以10×PCR buffer1ul、Mg2+1.25ul、dNTP1.2ul、引物0.25ul、Taq酶0.3ul、ddH2O3.45ul为基础,模板DNA为2ul (50ng/ul),通过实验摸索PCR的最佳退火温度,优化反应体系,对硬叶兜兰进行核基因ITS间隔子扩增,通过0.8%琼脂糖凝胶电泳在Bio-Rad凝胶成像系统筛选可行反应产物。反应产物经测序分析,目的基因片段大小在793-809bp , 通过NBCI网上在线对比分析证实为硬叶兜兰的ITS基因,该基因与同属植物的同源性为90%-99%。 关键词:硬叶兜兰;ITS间隔子扩增;反应体系 精心整理 仅供参考 勿用作商业用途 经典专科、本科、硕博、研究生、期刊毕业论文 仅供参考 精心整理 仅供参考 勿用作商业用途 目录 经典专科、本科、硕博、研究生、期刊毕业论文 仅供参考 精心整理 仅供参考 勿用作商业用途 1 前言 2 1.1 兜兰属植物的概况 2 1.2 兜兰属植物研究进展 4 1.2.1 兜兰属植物的繁殖方法 4 1.2.2 ITS技术在兰科植物中的运用 6 1.3 研究的目的及意义 7 2材料与方法 9 2.1 材料收集与处理 9 2.2 DNA的提取 9 2.3 ITS-PCR反应体系的建立及确定引物退火温度 10 2.3.1 ITS-PCR反应体系的建立 10 2.3.2确定引物退火温度 11 2.4 产物的检测与数据分析 11 2.5 试剂与仪器 11 3 结果与分析 12 3.1 DNA质量检测结果 12 3.2 ITS-PCR反应体系 13 3.3退火温度的确定 13 3.4 目的基因生物学信息 13 3.5 四个居群DNA序列变异情况 16 结论与讨论 21 参考文献 22 指导老师简介 24 致谢 25 精心整理 仅供参考 勿用作商业用途 1 前言 1.1 兜兰属植物的概况 兜兰,也称“女士拖鞋兰”、“仙履兰”,是兰科(Orchidaceae)兜兰属(Paphiopedilum)植物的统称。在拉丁语中,兜兰属名Paphiopedilum由爱神Paphos和鞋Pedilon组成。世界上大约有66种兜兰属植物。近年来,已发现10多个新物种,总数超过80种[1]。兜兰属于亚热带植物,主要分布于东南亚至喜马拉雅低地至中国西南部,仅有少数物种分布在新几内亚和所罗门群岛。中国是兜兰属植物的主产区之一,有18种,主要生长在西南各省和地区,华南地区分布很少[2]。大多数种类的分布范围很窄,并具有一定的区域特征。例如杏黄兜兰(Paphiopedilum armeniacum)、硬叶兜兰(P. micranthum)、麻栗坡兜兰(P. malipoense)仅分布在热带过渡区的石灰岩山地中,而紫色兜兰具有更广泛的分布区域。陈心启等人认为,已知品种的最原始的代表品种可能是麻栗坡兜兰,是一个从杓兰属向兜兰属演化的中间类型或过渡类型。在我国各省的分布情况:(1)云南有14种,占全国的77.8%,占世界的21.5%。其中:紫纹兜兰(P. purpuratum)、同色兜兰(P. concolor)、带叶兜兰(P. hirsutissimum)在云南全境都有分布; 享利兜兰(P. henryanum)、巨瓣兜兰(P. bellatulum)、紫毛兜兰(P. villosum)主要分布于云南的东南部;飘带兜兰(P. parishii)、长瓣兜兰(P. dianthum)、硬叶兜兰(P. micranthum)主要分布在云南南部; 杏黄兜兰(P. armeniacum)和虎斑兜兰(P. markianum)主要分布于云南的西部;彩云兜兰(P. wardii)、波瓣兜兰(P. insigne)则分别分布于云南的西南部和西北部(2)贵州有7种,占全国的38.9%,主要有小叶兜兰(P. barbig

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