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- 2020-10-04 发布于江苏
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西南林业大学
本科毕业(设计)论文
(2018届)
题目:硬叶兜兰居群水平的ITS基因扩增与信息分析
教学院系 园林学院 专 业 园艺14
学生姓名 张如礼
指导教师 李宗艳(副教授)
评 阅 人
2018年4月3日
硬叶兜兰居群水平的ITS基因扩增与信息分析
张如礼
(西南林业大学园林学院,昆明650224)
摘要 为优化兜兰ITS-PCR反应体系,以硬叶兜兰为试材,用改良的2×CTAB提取总的DNA,以10×PCR buffer1ul、Mg2+1.25ul、dNTP1.2ul、引物0.25ul、Taq酶0.3ul、ddH2O3.45ul为基础,模板DNA为2ul (50ng/ul),通过实验摸索PCR的最佳退火温度,优化反应体系,对硬叶兜兰进行核基因ITS间隔子扩增,通过0.8%琼脂糖凝胶电泳在Bio-Rad凝胶成像系统筛选可行反应产物。反应产物经测序分析,目的基因片段大小在793-809bp , 通过NBCI网上在线对比分析证实为硬叶兜兰的ITS基因,该基因与同属植物的同源性为90%-99%。
关键词:硬叶兜兰;ITS间隔子扩增;反应体系
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目录
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1 前言 2
1.1 兜兰属植物的概况 2
1.2 兜兰属植物研究进展 4
1.2.1 兜兰属植物的繁殖方法 4
1.2.2 ITS技术在兰科植物中的运用 6
1.3 研究的目的及意义 7
2材料与方法 9
2.1 材料收集与处理 9
2.2 DNA的提取 9
2.3 ITS-PCR反应体系的建立及确定引物退火温度 10
2.3.1 ITS-PCR反应体系的建立 10
2.3.2确定引物退火温度 11
2.4 产物的检测与数据分析 11
2.5 试剂与仪器 11
3 结果与分析 12
3.1 DNA质量检测结果 12
3.2 ITS-PCR反应体系 13
3.3退火温度的确定 13
3.4 目的基因生物学信息 13
3.5 四个居群DNA序列变异情况 16
结论与讨论 21
参考文献 22
指导老师简介 24
致谢 25
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1 前言
1.1 兜兰属植物的概况
兜兰,也称“女士拖鞋兰”、“仙履兰”,是兰科(Orchidaceae)兜兰属(Paphiopedilum)植物的统称。在拉丁语中,兜兰属名Paphiopedilum由爱神Paphos和鞋Pedilon组成。世界上大约有66种兜兰属植物。近年来,已发现10多个新物种,总数超过80种[1]。兜兰属于亚热带植物,主要分布于东南亚至喜马拉雅低地至中国西南部,仅有少数物种分布在新几内亚和所罗门群岛。中国是兜兰属植物的主产区之一,有18种,主要生长在西南各省和地区,华南地区分布很少[2]。大多数种类的分布范围很窄,并具有一定的区域特征。例如杏黄兜兰(Paphiopedilum armeniacum)、硬叶兜兰(P. micranthum)、麻栗坡兜兰(P. malipoense)仅分布在热带过渡区的石灰岩山地中,而紫色兜兰具有更广泛的分布区域。陈心启等人认为,已知品种的最原始的代表品种可能是麻栗坡兜兰,是一个从杓兰属向兜兰属演化的中间类型或过渡类型。在我国各省的分布情况:(1)云南有14种,占全国的77.8%,占世界的21.5%。其中:紫纹兜兰(P. purpuratum)、同色兜兰(P. concolor)、带叶兜兰(P. hirsutissimum)在云南全境都有分布; 享利兜兰(P. henryanum)、巨瓣兜兰(P. bellatulum)、紫毛兜兰(P. villosum)主要分布于云南的东南部;飘带兜兰(P. parishii)、长瓣兜兰(P. dianthum)、硬叶兜兰(P. micranthum)主要分布在云南南部; 杏黄兜兰(P. armeniacum)和虎斑兜兰(P. markianum)主要分布于云南的西部;彩云兜兰(P. wardii)、波瓣兜兰(P. insigne)则分别分布于云南的西南部和西北部(2)贵州有7种,占全国的38.9%,主要有小叶兜兰(P. barbig
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