生物信息学_复习题及答案(打印).pptxVIP

一、名词解释： 生物信息学： 研究大量生物数据复杂关系的学科，其特征是多学科交叉，以互联网为媒介，数据库为载体。利用数 学知识建立各种数学模型; 利用计算机为工具对实验所得大量生物学数据进行储存、检索、处理及分析，并以生物学知 识对结果进行解释。 二级数据库：在一级数据库、实验数据和理论分析的基础上针对特定目标衍生而来，是对生物学知识和信息的进一步 的整理。 FASTA 序列格式：是将 DNA 或者蛋白质序列表示为一个带有一些标记的核苷酸或者氨基酸字符串，大于号（）表 示一个新文件的开始，其他无特殊要求。 genbank 序列格式：是 GenBank 数据库的基本信息单位，是最为广泛的生物信息学序列格式之一。该文件格式按域 划分为 4 个部分：第一部分包含整个记录的信息（描述符）；第二部分包含注释；第三部分是引文区，提供了这个记 录的科学依据；第四部分是核苷酸序列本身，以“//”结尾。 Entrez 检索系统：是NCBI 开发的核心检索系统，集成了 NCBI 的各种数据库，具有链接的数据库多，使用方便，能 够进行交叉索引等特点。 BLAST：基本局部比对搜索工具，用于相似性搜索的工具，对需要进行检索的序列与数据库中的每个序列做相似性 比较。P94 查询序列（query sequence）：也称被检索序列，用来在数据库中检索并进行相似性比较的序列。P98 打分矩阵（scoring m