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NCBI 序列提交方法
NCBI 提交序列有两大类方式,一个是批量提交一个是单个序列提交。下面说的就是单个序
列提交方式,这是最新的提交方式,由于 NCBI 更新很快,也许过段时间又不一样了,主要
是按钮位置可能会变。
首先要注册一个自己的 NCBI 账号:点击此处注册
然后登陆账号:
在已登陆状态下点击 Submit
:
点击图中标记处选择 GengBank :
点击 GO :
选择:Banklt:
建议认真阅读填写要求等:点击 Sign in to use Banklt
点击 New Sub,下面是你提交的记录,即使你提交过程中中断了,也可以 Continue!
以下是具体提交过程:
一..填写基本信息
二.
1. 图中 1 是作者名字,可以添加作者名,First 和 Last Name,填了就可以,其他可以不填。
2. 图中 2 是填是否出版,有三个选项:未出版,正在出版,已经出版。需要注意的是,如
果选则未出版,需要在Title 中注明,否则无法提交。
3. 可以添加作者,然后 Continue 即可。
三.这是选择是用生么测序方法后的的序列
1. 现在我们用的一次只能测一条序列的都是 Sanger 测序,下面的 454 等都代表仪器型号,
是我们现在说的高通量测序,简单的书不同型号灵敏度不同。
2. 这是选择你测序是一个反应还是几个反应,就是你这条序列是一个测序结果就出来了,
还是几个测序结果拼在一起得到的结果,一代测序一个反应最可信的测序范围是
50-750bp,根据实际选择,然后继续。
四. 填写序列信息:
1.选择什么时候公布你的序列信息,你可以选怎立刻,也可以选择在以后的某一时间,如果
你选择了时间,那么即使你已经上传序列,有了序列号,在时间未到的时候你也是找不到的。
2.选择你的序列是不是 16SrRNA 基因是细菌上编码 rRNA 相对应的 DNA 序列,可能有一个专
门的库,所以一般选择 NO
3.选择你的序列类型,1.我选了 cDNA ,然后选择是什么类型:是线性,我们一般的都是线状
的,还是环状一般想线粒体,叶绿体或者各种质粒都是现状的。
4.然后填写你上传了多少个序列,黏贴序列,注意序列一定要是 FASTA 格式。你也可以选择
上传文档,这个自己学。然后继续两次继续。
五.填写你上传序列所属物种。然后即使继续。
六.选择你要你的序列式原始序列,就是你自己测序的序列,还是为已有序列做注释。
然后继续。
七.序列信息
1. 填写你基因所属细胞器
2. 填写你对基因的注释,可以添加选项,根据自己实际情况添加。
3. 最下面可以添加你的 PCR 引物,然后继续,会让你检查,你检查后继续即可。
八.信息补充
1. 填加序列信息,可以上传文件,也可以选项填写,建议用选项。
2. 选择你的信息,可以添加,然后继续
在上图中选择添加选项,会让你填写模板是正链还是负链,如果是部分序列,是哪一端,产
物是指你把序列通过 BlastP 比对后的到的序列号(qualifiers )和相似度(Value),然后 Accept 。
跳转后然后继续。
九.最后会让你最终检查你的信息和再次确认你有没有要求,如果没有问题,就 Finish。我
是随便找的序列,不能提交的所以没法显示提交后给你的基因 ID。
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