- 1、本文档共54页,可阅读全部内容。
- 2、原创力文档(book118)网站文档一经付费(服务费),不意味着购买了该文档的版权,仅供个人/单位学习、研究之用,不得用于商业用途,未经授权,严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等,侵权必究。
- 3、本站所有内容均由合作方或网友上传,本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺!文档内容仅供研究参考,付费前请自行鉴别。如您付费,意味着您自己接受本站规则且自行承担风险,本站不退款、不进行额外附加服务;查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档,您可以点击 这里二次下载。
- 4、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等,请点击“版权申诉”(推荐),也可以打举报电话:400-050-0827(电话支持时间:9:00-18:30)。
查看更多
结核分枝杆菌基因组学
黄海荣
国家结核病参比实验室
提纲
一、结核分枝杆菌基因组总论
目前一些相关实验室技术的遗传学背景
1基因分型技术
2耐药的分子生物学诊断
3新近的新疫苗、免疫诊断技术
Genome ofM. tuberculosis
More Than
Maps of
4,000 genes
other spp.
nearly identical
M. tuberculosis
4,411.529bp
Cole et al.(1998)
Nature393:537-544
A
diamete
Large groove
(-2A
34
Length of one
Small groove
pposite polarity
Axis
The Structure of DNA
5′end
bases
C
minor
groove
3end
p-O
0.34nm
major
g
roove
AG A
0-P-O
O=P-O
hydrogen bond
phosphodiester
5′end
Figure 4-5. Molecular Biology of the Cell, 4th Edition
TABLE 11.1 The genetic Code
First
Third
Position
econd
Positio
(5-end)
Positio
(3’end)
UUU Phe
UCU Ser
UAU Tyr
UGU CYS
UUC Phe UCC Se
UAC TVI
UGC C\
UUA Leu UCA Ser UAA Stop UGA Stop
UUG Leu
UCG Ser UAG Stop UGG Trp G
CUU Leu CCU Pro CAU His
CGU Arg
CUC Lo
CCC Pro CAC His
CGC Arg
CUA Let
CCA Pro
CAA GIn
CGA Arg
CUG Leu CCG Pro CAG GIn
CGG Arg
AUU lle ACU Thr AAU Asn AGU Ser
AUC lle
ACC Thi
AAC Asn
AGC Ser
A
AUA le
ACA Thr
AAA I
AGA Arg
AUG Meta
ACG Thr AAG Lv
AGG Arg
UCAGUCAGUCAGUCA
GUU Val GCU Ala GAU Asp GGU Gly
GUC Val
GCC Ala GAC Asp GGC Gly
GUA Val
GCA Ala
GAA Glu
GGA GI
GUG Val GCG Ala GAG Glu GGG Gly
Native double
Strands
Double helix
strands
reformed
Heat
M
Cool
Denaturation
Renaturation
Hierarchical Shotgun Sequencing Method
这 Genomic dNA
BAC Library
Create contig mi
Sequence each conti
with Shotgun Appoach
Align Contiguous Sequences
GCHTICGAGILHCCHGACRACO
GG TACTGAGGACCCRAGAGC
F.rj
Whole genome shotgun sequencing
of shotgun
ic DNA
partial digestion
overlapping DNA
了N
f 1-2 kb
Whole genome Shotgun Sequencing Method
Genomic dna
Sequence Each Fiagment
with Shotgun Approach
CCATVICGAGTIACCTGGACRACCAGT
lign Contiguous Sequences
TSP.
Gtnelate Fmished secnutct
文档评论(0)