VASP并行版详细安装教程.docVIP

vasp5.3.5 安装教程 制作者：甄江苏（湘潭大学材料科学与工程学院） 安装 Intel 编译器： 。。。。。。。。 然后添加环境变量，在 /etc/profile 文件中最下面插入： source /opt/intel/composer_xe_2015.2.164/bin/ifortvars.sh intel64 source /opt/intel/composer_xe_2015.2.164/mkl/bin/mklvars.sh intel64 然后在终端执行： [root]# source /etc/profile 这里提供的安装包会把其他的 Intel 的组件包括并行编译器也安装上，但是后面不用它 的 mpirun 这个 命令，而 是用 mpich 的 mpirun 命 令， 所以 进入/opt/intel/composer_xe_2015.2.164/文件夹，把文件夹 mpirt 改名，让它的路径失 效，比如改成 mpirt11111。 此外，安装完后后，最好把 licence文件放到安装目录里， Intel 编译器指定的 license 存放目录之一是 /opt/intel/composer_xe_2015.2.164/license/这个文件夹，这个文件夹要自己新建，然后把 license 文件拷贝进去即可，不然的话，对于共享此软件的其他节点来说，会找不到 license。 然后进入 /opt/intel/composer_xe_2015.2.164/mkl/interfaces/fftw3xf/文件夹，执行： [root]# make libintel64 将会生成一个名为 libfftw3xf_intel.a 的静态库文件，用于后面 vasp 的链接。 安装 openmpi：(openmpi 总是出问题，无法多节点并行，原因不明，所以建议用后面的 mpich) 进入 openmpi 解压目录，执行： [root]# ./configure --prefix=/opt/openmpi CC=icc CXX=icpc F77=ifort FC=ifort [root]# make all install 然后添加环境变量，在 /etc/profile 中添加： export PATH=$PATH:/opt/openmpi/bin export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/opt/openmpi/lib export MANPATH=$MANPATH:/opt/openmpi/share/man 然后在终端执行： [root]# source /etc/profile 3. 安装 mpich3: 将 mpich3 压缩包解压，然后进入，执行： [root]# ./configure --prefix=/opt/mpich3 --enable-fortran=all --enable-cxx F77=ifort FC=ifort FCFLAGS= -O2 -xHost FFLAGS= -O2 -xHost \ CC=icc CXX=icpc CFLAGS= -O2 –xHost CXXFLAGS= -O2 -xHost \ --enable-threads=multiple --enable-fast=all --enable-mpit-pvars=all [root]# make -j 8 [root]# make install 然后添加环境变量： export PATH=$PATH:/opt/mpich3/bin export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/opt/ mpich3/lib 然后在终端执行： [root]# source /etc/profile 注意，安装完并行库 (不论是 openmpi 还是 mpich)后，都要设置一下： 在 /etc/目录中新建一个名为 mpd.conf 的文本文件，在里面填写上： MPD_SECRETWORD=mr45-j9z 然后保存退出，给这个文件加上权限： [root]# chmod 600 /etc/mpd.conf 4. 安装 vasp（包含 NEB ） 将 vasp 的两个压缩包放到一个文件夹中 (比如命名为 VASP_Install)，并将这两个压缩包解压，会得到名为 vasp.5.3 和 vasp.5.lib 两个目录，然后进入 vasp.5.lib 文件夹中，找到名为 makefile.linux_ifc_P4 的文件，打开修改： 将“ FC=ifc”改为“ FC=ifort ”，然后保存退出，并在终端执行： [root]# make -f makefil