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- 2020-11-18 发布于山东
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单细胞 RNA 测序的样本制备指南
在开展单细胞 RNA 测序之前,我们首先要妥善地制备
单细胞样本。这虽然有点困难,但本文介绍了一些诀窍和建
议,也许对您的实验有所帮助。 这主要适用于 10x Genomics 的 Chromium? Single Cell 3 ’ Solution不过也,同样适用于其他方案。 单细胞 RNA 测序( scRNA-seq )是一种强大的
工具,让研究人员能够揭开复杂的生物学系统,分析各个细胞的基因表达动态,从而深入了解疾病发展过程中的细胞进程。在此之前,分析混合细胞群体的基因表达一直是一项困难的任务。
当然,在开展单细胞 RNA 测序之前,我们首先要妥善地制
备单细胞样本。这虽然有点困难,但本文介绍了一些诀窍和
建议,也许对您的实验有所帮助。这主要适用于 10x
Genomics 的 Chromium? Single Cell 3 ’ Solution ,不过也同
样适用于其他方案。
了解您的样本样本制备的具体方案因样本类型而异,但无论
采用哪种方案,您都必须要确保上样的细胞是有活力的,并
且完全解离成单细胞。无论是细胞系还是组织,优化细胞解
离的操作都是必不可少的,这样才能避免细胞死亡和裂解。
死细胞会裂解,释放出 RNA 。这种游离 RNA 会增加背景噪
音,影响单细胞数据的质量。
目前有不少现成的样本制备方案,但也许需要针对您的样本类型
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